核心结论：车祸当天轻微伤三年后查出其他病情，能否获得赔偿以及如何赔偿，需分情况讨论，主要取决于新病情与车祸是否存在因果关系。以下分情况详细说明：
若新病情与车祸存在因果关系
- 因果关系认定：需要专业的医疗鉴定机构出具鉴定意见，证明三年后查出的病情是由车祸当天所受轻微伤直接引发、诱发或者存在其他关联。例如，车祸当时头部受到轻微撞击，当时未表现出严重症状，但三年后出现脑部病变，经鉴定该病变与三年前的撞击存在因果关系。
- 赔偿主体：如果车祸是由对方全责或者主要责任导致的，那么赔偿主体为对方及其保险公司（如果对方车辆投保了相关保险）。若自己也有一定责任，则按照责任比例分担赔偿责任。
- 赔偿范围：包括医疗费，即因治疗新病情所花费的合理费用，如挂号费、检查费、药费、住院费等；误工费，根据受害人的误工时间和收入状况确定，误工时间根据受害人接受治疗的医疗机构出具的证明确定；护理费，如果受害人因病情需要护理，根据护理人员的收入状况和护理人数、护理期限确定；交通费，受害人及其必要的陪护人员因就医或者转院治疗实际发生的费用；住院伙食补助费，可以参照当地国家机关一般工作人员的出差伙食补助标准予以确定；营养费，根据受害人伤残情况参照医疗机构的意见确定；残疾赔偿金（如果新病情导致残疾），根据受害人丧失劳动能力程度或者伤残等级，按照受诉法院所在地上一年度城镇居民人均可支配收入或者农村居民人均纯收入标准，自定残之日起按二十年计算；精神损害抚慰金（如果新病情给受害人造成严重精神损害）等。
若新病情与车祸不存在因果关系
- 赔偿情况：在这种情况下，一般无法要求车祸责任方对新病情进行赔偿。因为赔偿的前提是侵权行为与损害结果之间存在因果关系，既然新病情与车祸没有关联，那么车祸责任方就没有义务对新病情的治疗费用等承担赔偿责任。
- 其他途径：如果新病情是由于自身疾病或者其他原因导致的，受害人可以通过医疗保险等途径来减轻自己的医疗负担。
建议：如果遇到这种情况，首先要及时收集相关证据，如车祸当时的诊断证明、治疗记录，三年后新病情的诊断证明、治疗费用单据等。然后尽快委托专业的医疗鉴定机构进行因果关系鉴定。如果鉴定结果认为新病情与车祸存在因果关系，可以与对方协商赔偿事宜，协商不成的，可以向法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。有问题可以直接向我咨询。