针对您提出的“税务稽查发现阴阳合同会怎么办”这一问题，我将从税务稽查的查处方式、法律后果以及应对建议三个方面，为您进行详细解答。
一、税务稽查的查处方式
税务局在发现阴阳合同后，会采取一系列行之有效的措施进行查处，主要包括：
数据监测与分析：
- 税务局利用税收征管信息系统，对企业和个人的申报数据进行全面监控，自动预警异常申报，如价格明显异常的房地产交易或收入申报与同行业差距过大的情况。
- 通过与工商、银行、不动产登记中心等部门的信息共享，核查税务申报的真实性，如股权转让中与工商部门提供的股权变更信息进行比对。
日常征管与检查：
- 税务人员在受理纳税申报时，会细致审核提交的合同等资料，检查其合理性、完整性及其与其他申报数据的关联性。
- 开展专项检查行动，如针对特定行业的阴阳合同整治，以及不定期对纳税人进行抽查，全面检查其合同、发票、账簿等资料。
- 对重点税源企业或税收风险较高的纳税人进行深入的税务审计，审查其生产经营活动和财务核算情况。
举报与线索追踪：
- 税务局设有专门的举报渠道，鼓励社会各界提供阴阳合同等税收违法行为的线索。
- 接到举报后，税务机关会迅速组织人员进行调查核实，收集证据，并对可能涉及的上下游企业和关联方进行延伸调查。
加强日常监管与技术手段应用：
- 通过对比企业申报的税收数据和实际经营情况，分析成本结构和利润率，关注资金流向等手段，加强日常监管。
- 利用现代科技手段，如大数据分析，发现不正常的交易模式或资金流动，对可疑合同进行深入调查。
协同其他部门合作：
- 税务局积极与其他政府部门、机构或国际组织合作，共同打击跨领域的偷逃税行为，包括阴阳合同。
二、法律后果
一旦查实存在阴阳合同，相关责任人将面临严重的法律后果，包括但不限于：
- 补缴税款：根据阴阳合同导致的偷逃税款金额，税务机关将要求纳税人补缴相应的税款。
- 滞纳金：对于未按时缴纳的税款，税务机关将按照规定加收滞纳金。
- 刑事处罚：在严重情况下，如涉及大额偷逃税款或构成犯罪的，相关责任人可能面临刑事处罚，如有期徒刑、罚金等。
三、应对建议
面对税务稽查发现的阴阳合同问题，我建议您采取以下措施：
- 严格遵守税法规定：确保所有合同和申报都真实、准确、完整，避免任何形式的偷逃税行为。
- 积极配合税务稽查：如果税务机关已经发现并开始调查阴阳合同问题，您应积极配合税务机关的调查工作，提供必要的资料和证据。
- 寻求专业法律帮助：如果您对税务稽查过程或法律后果有疑问或担忧，建议寻求专业律师的帮助，以了解您的权利和义务，并制定合适的应对策略。
- 及时整改与纠正：如果发现存在阴阳合同问题，应立即进行整改和纠正，确保未来的合同和申报都符合税法规定。
总之，税务局通过多种方式严查阴阳合同，以确保税收的合法性和公平性。纳税人应严格遵守税法规定，诚实申报纳税，避免签订阴阳合同带来的法律风险。如果遇到相关问题，建议积极配合税务机关的调查工作，并寻求专业法律帮助。