结论：若司法鉴定意见明显与事实不符但已超过法定追诉期，处理方式需分情况讨论，主要包括通过申诉或抗诉途径寻求救济，以及考虑是否存在其他法律途径或程序来纠正错误鉴定。

详细分析：

1. 申诉或抗诉途径：

   • 申诉：如果认为司法鉴定意见存在错误，且该错误对案件的判决结果产生了实质性影响，即便已经超过了法定追诉期，仍可以考虑向相关司法机关提出申诉。申诉是当事人对已经发生法律效力的判决、裁定认为有错误，而向人民法院或者人民检察院提出的要求重新审查处理的请求。在申诉过程中，可以提交新的证据或指出原鉴定意见中的明显错误，以期引起司法机关的重视并重新审查。
   • 抗诉：如果案件已经进入执行阶段，且认为原判决、裁定存在错误，可以向人民检察院提出抗诉申请。抗诉是人民检察院对人民法院已经发生法律效力的判决、裁定，发现确有错误，依法提请人民法院重新审理的诉讼活动。通过抗诉，可以促使人民法院对案件进行重新审查，包括对原司法鉴定意见的重新评估。

2. 其他法律途径或程序：

   • 申请重新鉴定：在某些情况下，即便案件已经审结，如果发现原司法鉴定意见存在明显错误，且该错误对案件结果有实质性影响，仍可以尝试向相关司法机关申请重新鉴定。不过，这一途径的成功率可能较低，因为案件已经审结，司法机关可能不再愿意重新启动鉴定程序。但具体是否可行，还需根据案件的具体情况和相关法律法规来判断。
   • 寻求专业法律意见：在处理此类复杂问题时，寻求专业律师的法律意见至关重要。律师可以根据案件的具体情况，分析各种可能的法律途径和程序，为当事人提供有针对性的法律建议。

3. 注意事项：

   • 时效性：虽然超过了法定追诉期，但申诉和抗诉等法律途径仍有一定的时间限制。因此，在发现司法鉴定意见存在错误后，应尽快采取行动，以免错过最佳的救济时机。
   • 证据收集：在申诉或抗诉过程中，收集充分的证据来证明原司法鉴定意见的错误至关重要。这可能包括新的鉴定意见、专家意见、相关证人证言等。
   • 法律程序：不同的法律途径和程序可能有不同的要求和规定。因此，在采取行动前，应详细了解相关法律程序和要求，以确保行动的合法性和有效性。

后续行动建议：

• 立即收集所有与原司法鉴定意见相关的证据和材料，包括鉴定报告、专家意见、证人证言等。
• 咨询专业律师，了解具体的法律途径和程序，以及可能面临的法律风险和后果。
• 根据律师的建议，选择合适的法律途径和程序来寻求救济，如提出申诉、抗诉或申请重新鉴定等。

在处理此类问题时，请务必保持冷静和理性，遵循法律程序和规定，以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。