在起诉申通公司时，被申请人（即被告）一栏应填写申通公司的全称，具体需根据其企业类型和注册信息来确定。以下是详细说明：

1. 确认申通公司的全称及注册信息
   首先，您需要明确与您发生纠纷的具体是申通快递的哪家公司。申通快递品牌下可能涉及多个关联企业，如“申通快递有限公司”、“某地申通物流有限公司”等。您可以通过以下方式确认：

   • 查看快递面单、物流信息或与您沟通的申通工作人员所属公司名称；
     
   • 通过国家企业信用信息公示系统（官网）查询申通快递相关企业的注册信息，包括全称、统一社会信用代码、注册地址等。
     

2. 根据企业类型填写被申请人信息

   • 若申通公司为有限责任公司或股份有限公司：
     被申请人应填写其全称，例如“申通快递有限公司”，并注明统一社会信用代码（如已知）。
     
   • 若申通公司为分公司或分支机构：
     若您是与申通的具体分公司（如“申通快递有限公司上海分公司”）发生纠纷，且该分公司有独立营业执照，可直接将其列为被申请人；若分公司无独立财产，也可将总公司列为共同被告。
     
   • 若涉及加盟网点或个体经营者：
     若纠纷是与申通加盟网点或个体承包商发生，需确认其是否以申通品牌名义经营。若以申通名义且构成表见代理，可同时将申通公司和实际经营者列为共同被告。
     

3. 注意事项

   • 准确性：被申请人名称必须与营业执照或工商登记信息完全一致，否则可能因主体不适格被法院驳回起诉。
     
   • 管辖法院：根据《民事诉讼法》，起诉需向被告住所地或合同履行地法院提交材料。若申通公司为被告，通常需到其注册地或实际经营地法院起诉。
     
   • 证据准备：除填写正确的被申请人信息外，还需准备与纠纷相关的证据（如快递单、损失证明、沟通记录等），以支持您的诉讼请求。
     

建议：若您对申通公司的具体主体或法律关系存在疑问，可进一步向我描述纠纷细节（如快递丢失、延误、损坏等），我将结合具体情形为您分析被申请人如何确定及诉讼策略。