结论：公司注册资本100万，对方诉1000万败诉后，公司应承担的金额并非直接由注册资本或诉讼标的额决定，而是取决于败诉的具体原因、合同约定、实际损失及法律规定等多个因素。以下从不同角度进行分析：

一、败诉原因与责任承担

1. 合同违约：

   • 若公司因违反合同约定而被判败诉，那么公司需承担的责任通常限于合同约定的违约责任范围，包括但不限于赔偿对方因此遭受的直接损失、间接损失（如可得利益损失）以及违约金等。
   • 计算公式（以赔偿损失为例）：赔偿金额 = 对方实际损失 + 合理费用（如律师费、诉讼费等，若合同有约定或法律有规定）。
   • 示例：若合同约定违约金为合同金额的20%，且对方实际损失未超过该违约金数额，则公司可能需支付200万（1000万*20%）作为违约金。但若实际损失远低于此，法院可能根据公平原则调整违约金数额。

2. 侵权行为：

   • 若公司因侵权行为（如侵犯知识产权、商业秘密等）而被判败诉，那么公司需承担的责任包括赔偿对方因此遭受的损失、停止侵权行为、消除影响等。
   • 计算公式：赔偿金额 = 对方实际损失 + 合理费用（如调查取证费、律师费等）。
   • 示例：若对方因公司侵权行为遭受了500万的实际损失，并产生了50万的合理费用，则公司可能需赔偿550万。

3. 其他法律责任：

   • 除了合同违约和侵权行为外，公司还可能因其他法律行为（如违反行政法规、刑事犯罪等）而承担法律责任。这些责任的承担方式和金额将根据具体法律法规和案件情况而定。

二、注册资本与责任承担的关系

• 注册资本的作用：注册资本是公司设立时股东认缴的出资额，它反映了公司的初始资本实力和股东对公司的承诺。然而，注册资本并不直接决定公司败诉后需承担的责任金额。
• 责任限额的例外：在某些特定情况下（如公司法人人格否认、股东滥用权利等），股东可能需对公司债务承担连带责任。但这种情况下的责任承担并不受注册资本的限制，而是根据具体法律规定和案件情况而定。

三、实际损失与责任承担

• 实际损失的确定：在诉讼中，对方需证明其因公司行为而遭受的实际损失。法院将根据对方提供的证据和法律规定来确定实际损失的金额。
• 责任承担的范围：公司败诉后需承担的责任通常限于对方因公司行为而遭受的实际损失和合理费用。若公司能够证明对方主张的损失过高或不合理，法院可能根据公平原则调整赔偿金额。

四、建议与措施

1. 审查合同和证据：公司应仔细审查与对方签订的合同和相关证据，以确定败诉的具体原因和责任承担范围。
2. 积极应诉和调解：在诉讼过程中，公司应积极应诉并寻求调解机会，以降低败诉风险和减少损失。
3. 咨询专业律师：由于法律问题复杂多变，公司应咨询专业律师以获取更具体和准确的法律建议。

如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供详细的法律分析和建议。