在非法经营电子烟的案件中，非法经营数额的认定并非单纯以查到的为准或以供述的为准，而是需要综合全案证据进行判断。以下是对此问题的详细分析：

1. 证据的全面性与客观性：

   • 在刑事案件中，证据的收集应当全面、客观，既要包括查获的实物证据，如电子烟的数量、销售记录等，也要包括被告人的供述、证人证言等言词证据。
   • 查到的实物证据和销售记录等客观证据，通常具有较高的证明力，因为它们直接反映了非法经营活动的实际情况。
   • 被告人的供述虽然也是重要的证据来源，但其证明力相对较弱，因为供述可能受到被告人主观因素的影响，如记忆错误、故意隐瞒或夸大等。

2. 非法经营数额的认定原则：

   • 根据刑事诉讼法的规定，认定案件事实应当以证据为依据，证据确实、充分的，才能认定被告人有罪和处以刑罚。
   • 在非法经营案件中，非法经营数额的认定应当遵循客观、公正、合理的原则，既要考虑查到的实物证据和销售记录等客观证据，也要结合被告人的供述、证人证言等言词证据进行综合判断。
   • 如果查到的实物证据和销售记录等客观证据能够清晰、准确地反映非法经营活动的实际情况，那么这些证据应当作为认定非法经营数额的主要依据。
   • 如果被告人的供述与客观证据相符，且没有其他相反证据，那么供述也可以作为认定非法经营数额的参考依据。但如果供述与客观证据存在矛盾，或者被告人拒不供述，那么应当以客观证据为准。

3. 特殊情况下的处理：

   • 在某些特殊情况下，如查到的实物证据不完整或存在争议，或者被告人拒不供述且没有其他直接证据证明非法经营数额时，法院可能会根据案件的具体情况，结合其他间接证据和常识、经验法则等进行综合判断。
   • 例如，法院可能会根据电子烟的市场价格、销售渠道、销售方式等因素，结合被告人的供述和证人证言等间接证据，对非法经营数额进行合理推断。

4. 法律后果与量刑标准：

   • 非法经营罪的量刑标准主要根据情节的严重程度来确定，其中非法经营数额是一个重要的考量因素。
   • 根据《中华人民共和国刑法》第二百二十五条的规定，非法经营行为情节严重的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。
   • 因此，在非法经营电子烟的案件中，准确认定非法经营数额对于确定被告人的量刑具有重要意义。

总结来说，在非法经营电子烟的案件中，非法经营数额的认定应当综合全案证据进行判断，既要考虑查到的实物证据和销售记录等客观证据，也要结合被告人的供述、证人证言等言词证据进行综合判断。如果查到的证据清晰、准确，那么应当以这些证据为准；如果证据存在争议或不足，那么法院可能会根据案件的具体情况进行合理推断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。