基金亏空且已立案的情况下，能否追回本金需分情况讨论，具体取决于案件性质、资金流向、管理人责任及司法程序进展。以下从不同角度展开分析：

1. 案件性质决定追偿可能性

• 刑事案件（如非法集资、诈骗）：若基金管理人涉嫌刑事犯罪（如集资诈骗、非法吸收公众存款），公安机关立案后，会启动追赃挽损程序。根据《刑法》第六十四条，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或责令退赔。若资金未被挥霍或转移，投资者可能通过司法程序按比例获赔；但若资金已被转移或挥霍，追偿难度会显著增加。
• 民事纠纷（如管理人违约）：若基金亏损因管理人未尽勤勉义务（如违规操作、信息披露不实），投资者可依据《民法典》及《证券投资基金法》提起民事诉讼，要求管理人赔偿损失。若管理人具备偿付能力，投资者有望通过法院判决获得赔偿；但若管理人已破产或无力赔偿，追偿可能落空。

2. 资金流向是关键因素

• 资金被挪用或挥霍：若管理人将基金资金用于个人消费、高风险投资或非法活动，导致资金无法追回，投资者可能面临本金损失。此时需依赖司法机关追缴赃款，但实际执行中可能因资金分散、转移而难以全额追回。
• 资金用于合法投资但亏损：若基金因市场波动或投资失败导致亏损，且管理人无过错，投资者需自行承担风险。此时即使立案，司法机关也不会干预市场风险，投资者可能无法追回本金。

3. 管理人责任与赔偿能力

• 管理人存在过错：若管理人未履行合同约定（如未按约定投资范围操作、未及时披露风险），投资者可要求其承担违约责任。若管理人具备赔偿能力（如有资产、保险或第三方担保），投资者有望获赔；但若管理人已破产或无资产，赔偿可能无法实现。
• 管理人无过错：若亏损因市场风险或不可抗力导致，且管理人已尽到勤勉义务，投资者需自行承担损失，司法机关不会支持赔偿请求。

4. 司法程序进展影响结果

• 刑事案件中的退赔程序：在刑事案件中，法院会要求犯罪嫌疑人退赔投资者损失，并按比例分配。若退赔资金充足，投资者可能部分或全额获赔；但若退赔资金不足，投资者可能仅能获赔部分本金。
• 民事诉讼的执行阶段：若通过民事诉讼获得判决，但管理人无财产可供执行，法院会终结执行程序。此时投资者可申请管理人破产，通过破产清算分配剩余资产，但实际获赔比例可能较低。

行动建议：

1. 收集证据：保留基金合同、交易记录、宣传材料、管理人承诺等证据，以证明管理人过错或资金流向。
2. 参与司法程序：在刑事案件中配合公安机关调查，在民事诉讼中积极举证，争取最大程度追偿。
3. 关注资金流向：通过司法机关或第三方机构查询资金去向，若发现转移或隐匿资产，及时申请财产保全。
4. 联合其他投资者：若涉及多人受损，可联合提起集体诉讼或刑事附带民事诉讼，降低维权成本。

总结：基金亏空后能否追回本金，需结合案件性质、资金流向、管理人责任及司法程序综合判断。若涉及刑事犯罪且资金未被挥霍，追偿可能性较高；若为市场风险或管理人无过错，投资者可能需自行承担损失。建议立即收集证据并参与司法程序，以最大限度维护权益。如有进一步问题，可直接向我咨询。