结论：房屋抵押给个人还清后，一般不会有他项权证留存在抵押权人处，但抵押人应确保抵押权人配合办理注销登记，以彻底消除房屋上的抵押权负担。
详细解释与说明：
他项权证的定义与作用：
- 他项权证，全称为“房屋他项权证”，是房屋产权登记机关颁发给抵押权人或者典权人等他项权利人的法定凭证。它表明房屋除了产权人外，还存在其他权利人（如抵押权人）对该房屋享有一定的权利（如抵押权）。
抵押关系存续期间的情况：
- 在房屋抵押给个人期间，抵押权人会持有他项权证，作为其对该房屋享有抵押权的法律证明。此时，房屋的产权虽然仍属于抵押人，但抵押权人的权利受到法律保护，抵押人不能随意处置房屋。
抵押关系终止后的情况：
- 当抵押人还清全部债务后，抵押关系即告终止。此时，抵押权人应当配合抵押人办理抵押权的注销登记手续。注销登记完成后，他项权证通常会被收回或作废，不再具有法律效力。因此，在正常情况下，房屋抵押给个人还清后，不会有他项权证留存在抵押权人处。
抵押人应注意的事项：
- 抵押人在还清债务后，应主动与抵押权人联系，要求其配合办理抵押权的注销登记手续。这是抵押人的权利，也是确保房屋产权彻底恢复自由状态的重要步骤。
- 如果抵押权人拒绝配合或拖延办理注销登记手续，抵押人可以向房屋产权登记机关申请注销登记，或者通过法律途径维护自己的合法权益。
法律后果与风险提示：
- 如果抵押人未办理抵押权的注销登记手续，虽然债务已经还清，但房屋上仍可能存在抵押权的负担。这可能会影响抵押人后续对房屋的处置（如出售、再抵押等），甚至可能引发法律纠纷。
- 因此，抵押人在还清债务后，务必确保抵押权的注销登记手续得到妥善办理，以彻底消除房屋上的抵押权负担。
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