自主实习是否需要三方协议，主要取决于实习者的身份以及实习单位的具体要求和实际情况。以下是对这一问题的详细分析：

1. 对于在校学生的自主实习：

   • 毕业实习情况：如果是在校学生进行毕业实习，特别是到企业等正规单位进行与专业相关的实践活动，且实习单位有明确的录用意向，学生也愿意毕业后正式入职该单位，那么通常会需要签订三方协议。三方协议由学校、学生、用人单位三方共同签订，旨在保障学生实习期间的基本权益，如实习报酬、岗位、期限等，同时也为毕业生的就业提供了一定的法律保障。
   • 非毕业实习或短期实习：如果只是进行短期、临时性的实习，如学生利用寒暑假进行的社会实践性质实习，或者实习单位为小型企业、个体工商户等管理相对不规范的情况，可能不需要签订三方协议。这种情况下，双方一般会签订实习协议，明确实习期限、工作内容、实习报酬等权利义务。

2. 对于已经毕业人员的自主实习：

   • 不存在三方协议：已毕业人员不再涉及三方协议的问题。他们与实习单位建立的实习关系，应根据劳动关系的认定标准来确定是否需要签订劳动合同或其他协议。如果实习关系符合劳动关系的认定标准（如受用人单位管理、用人单位支付报酬、提供的劳动是用人单位业务的组成部分等），则应签订劳动合同，明确双方的权利和义务。如果实习关系不属于劳动关系，则可以签订实习协议、劳务协议等其他形式的协议，以保障自身权益和规范双方行为。

3. 关于三方协议与两方协议的选择：

   • 三方协议：主要用于解决应届毕业生在户籍、档案、保险、公积金等方面的相关问题。如果实习单位能够接收这些关系（如国企、事业单位等），则需要与学校、学生共同签订三方协议。
   • 两方协议：如果实习单位无法接收这些关系（如大多数民企），则只需要与学生签订两方协议，即劳动合同或实习协议，以明确双方的权利和义务。

建议与注意事项：

• 明确协议内容：无论签订三方协议还是实习协议，都应详细列明实习生的实习时间、工作时间、实习费、实习内容等细节，以及各方在实习期间的权利和义务。确保协议内容清晰、具体，避免模糊不清的表述。
• 审查用人单位资格：在签署协议前，应仔细审查用人单位的主体资格是否合法，以避免因用人单位资格问题导致的协议无效。
• 了解法律保障：即使未签署三方协议，实习生仍享有基本的法律保障。用人单位应为实习生提供符合国家规定的安全卫生的工作环境，保证其人身安全不受危害。

综上所述，自主实习是否需要三方协议，应综合考虑实习者的身份、实习单位的具体要求以及实际情况来做出判断。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。