在刑事案件中发现新线索，处理流程会根据案件所处的不同阶段而有所区别。以下是一个详细且分阶段的处理指南：
一、侦查阶段发现新线索
处理方式： 在侦查过程中，如果公安机关发现了犯罪嫌疑人涉嫌的其他罪行，通常会继续展开调查。例如，警方在侦破一起盗窃案时，通过审讯嫌疑人或调查其行踪，发现该嫌疑人还涉及另一起诈骗案件。此时，警方会将两起案件合并侦查，全面收集相关证据，确保对犯罪嫌疑人的所有犯罪行为进行彻底审查。
法律依据： 《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百一十五条规定，公安机关对已经立案的刑事案件，应当进行侦查，收集、调取犯罪嫌疑人有罪或者无罪、罪轻或者罪重的证据材料。
二、审查起诉阶段发现新线索
处理方式： 当案件移送至检察机关审查起诉后，如果发现新的犯罪事实，检察机关会要求公安机关补充侦查，或者自行侦查。比如，检察院在审查一起故意伤害案的卷宗时，发现被害人陈述中提及嫌疑人还有抢劫行为，但公安机关未对此进行调查。检察院会退回公安机关补充侦查，要求其查明抢劫事实；若认为有必要，也可直接开展侦查工作。
法律依据： 《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十五条规定，人民检察院审查案件，可以要求公安机关提供法庭审判所必需的证据材料；对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。
三、审判阶段发现新线索
处理方式： 如果在法院审理过程中发现新罪，根据不同情况有不同处理方式：
与已起诉罪名属同种罪行：一般应并案审理，不再另行起诉。例如，被告人被指控犯有多次盗窃罪，在审理中又发现其还有其他盗窃行为，法院会将新旧盗窃事实一并审理判决。
与已起诉罪名不同种且能单独成罪：原则上应另行起诉，与正在审理的案件并案处理。比如，被告人在审理中被指控贩卖毒品罪，又发现其之前还有故意杀人行为，法院可能会建议检察机关对新发现的故意杀人罪另行起诉，然后与原贩毒案并案审理。但如果新罪与原罪联系紧密，如基于同一犯罪目的实施的不同行为，也可能一并审理。
法律依据： 《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国刑事诉讼法〉的解释》第二百四十三条规定，审判期间，人民法院发现新的事实，可能影响定罪的，可以建议人民检察院补充或者变更起诉；人民检察院不同意或者在七日内未回复意见的，人民法院应当就起诉指控的犯罪事实，依照相关解释的规定作出判决、裁定。
四、特殊情形：审理民事案件发现刑事犯罪线索
在审理民事案件过程中，若发现刑事犯罪线索，法院也需遵循法定程序妥善处理：
初步审查与判断：承办法官或合议庭应对发现的犯罪线索进行初步审查，评估其真实性及与案件的关联性。
中止民事诉讼程序（视情况而定）：若刑事案件审理结果直接影响民事案件事实认定，法院可裁定中止诉讼。
移送公安机关或检察机关：法院应将犯罪线索及相关材料移送有管辖权的公安机关或检察机关，并附书面说明。
通知相关当事人：法院应及时告知民事案件当事人案件已移送刑事侦查的情况，并释明后续程序可能产生的法律后果。
恢复或终结民事诉讼：待刑事判决生效后，根据判决结果决定是否恢复民事诉讼。
特殊情形的处理规则：
注意事项：
综上所述，刑事案件中发现新线索的处理流程是一个复杂而细致的过程，需要依据不同阶段和具体情况进行灵活应对。希望以上解答能对您有所帮助。