扰乱军事管理区秩序罪的管辖问题，主要涉及刑事案件的管辖原则，具体分析如下：

1. 地域管辖原则：

   • 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释，刑事案件一般由犯罪地的人民法院管辖。犯罪地包括犯罪行为发生地和犯罪结果发生地。对于扰乱军事管理区秩序罪，犯罪行为发生地即军事管理区所在地，因此，该类案件通常由军事管理区所在地的人民法院管辖。
   • 若犯罪行为涉及多个地点，如犯罪预备地、实行地、结果地等，且这些地点不在同一人民法院辖区内，那么这些地点的人民法院都可能具有管辖权。但在此类特定案件中，由于军事管理区的特殊性，通常仍以军事管理区所在地的人民法院为主要管辖法院。

2. 级别管辖原则：

   • 扰乱军事管理区秩序罪的案件级别管辖，主要依据案件的性质、情节严重程度以及可能判处的刑罚等因素来确定。一般来说，基层人民法院管辖第一审普通刑事案件，但中级人民法院、高级人民法院和最高人民法院也分别管辖其认为应当由自己管辖的第一审刑事案件。
   • 对于扰乱军事管理区秩序罪，若情节较轻，可能判处较轻刑罚的，通常由基层人民法院管辖；若情节严重，可能判处较重刑罚的，则可能由中级人民法院或更高级别的人民法院管辖。

3. 专门管辖原则：

   • 考虑到军事管理区的特殊性，以及扰乱军事管理区秩序罪对军事安全和军事秩序的严重危害，此类案件可能由军事法院或专门的人民法院管辖。军事法院是审理军事人员犯罪案件的专门法院，对于非军事人员扰乱军事管理区秩序的案件，若情节严重，影响恶劣，也可能由军事法院或相关专门法院进行审理。不过，在大多数情况下，非军事人员扰乱军事管理区秩序的案件仍由地方人民法院管辖，具体取决于案件的具体情况和管辖法院的认定。

4. 特殊情况下的管辖：

   • 在某些特殊情况下，如犯罪嫌疑人、被告人逃匿、死亡，或者案件涉及国家秘密、个人隐私等，可能需要采取特殊的管辖措施。例如，对于逃匿的犯罪嫌疑人、被告人，可能通过通缉、追捕等方式将其缉拿归案后，再由有管辖权的人民法院进行审理。
   • 若案件涉及多个地区或多个法院的管辖权争议，可能需要通过上级人民法院的指定管辖或协商管辖等方式来解决。

法律建议：

• 若您或他人涉嫌扰乱军事管理区秩序罪，建议立即停止相关行为，并主动向有关部门投案自首，以争取从轻或减轻处罚。
• 在案件处理过程中，应积极配合司法机关的调查和审理工作，如实陈述事实，提供相关证据，以便司法机关能够准确认定案件事实，依法作出公正判决。
• 若您对案件管辖有疑问或需要法律帮助，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。