公司即使多年没有运作，也不会自动注销，而是需要依法进行清算和注销登记。以下从多个角度为您详细分析：
一、公司不会自动注销的原因
法律程序要求：
- 根据《中华人民共和国公司法》及相关法律法规，公司终止经营活动必须依法进行清算，清理债权债务，分配剩余财产，并办理注销登记。这一过程是法定的，不能自动完成。
保护债权人利益：
- 如果允许公司自动注销，可能会损害债权人的利益，因为公司在注销前可能仍有未清偿的债务。通过法定清算程序，可以确保债权人的合法权益得到保障。
维护市场秩序：
- 公司注销是市场退出机制的重要组成部分。依法注销有助于维护市场秩序，防止“僵尸企业”长期存在，影响市场资源的有效配置。
二、公司不经营后的处理建议
及时清算：
- 如果公司决定不再继续经营，应尽快成立清算组，开始清算工作。清算组由股东或董事组成，负责清理公司的财产、编制资产负债表和财产清单，并通知债权人申报债权。
办理注销登记：
- 清算结束后，清算组应制作清算报告，报股东会或有关主管机关确认，并报送公司登记机关申请注销登记。经登记机关核准后，公告公司终止。
避免长期吊销状态：
- 如果公司因连续六个月不开业或开业后自行停业连续六个月以上等原因被吊销营业执照，应及时办理注销手续。否则，公司法人资格虽然名义上丧失，但相关责任（如税务、债务等）仍可能存在。
三、长期不经营的后果
被列入异常名录：
- 公司成立后无正当理由超过六个月未开业的，或者开业后自行停业连续六个月以上的，可以由公司登记机关吊销营业执照，并被列入经营异常名录。
税务问题：
- 长期不经营的公司可能面临税务问题，如未按时申报纳税、欠税等。这不仅会导致罚款和滞纳金，还可能影响公司的信用记录。
法律责任：
- 如果公司在注销前未妥善处理债权债务关系，股东或董事可能需要承担连带责任或其他法律责任。
四、实际操作中的注意事项
- 清算组的组成与职责：清算组应由股东或董事组成，负责全面清理公司财产、编制资产负债表和财产清单，并通知债权人申报债权。清算组需确保清算工作的公正、透明，并依法处理公司剩余财产。
- 注销登记的流程：在清算结束后，清算组需制作清算报告，并报股东会或有关主管机关确认。随后，向公司登记机关申请注销登记，并提交相关材料。经登记机关核准后，公司即告终止。
- 税务与债务处理：在清算过程中，需特别注意税务问题的处理，确保按时申报纳税并缴纳欠税。同时，需妥善处理公司债务，避免股东或董事承担不必要的法律责任。
总结来说，公司即使多年没有运作，也不会自动注销。为了维护市场秩序、保护债权人利益和避免不必要的法律责任，公司应依法进行清算和注销登记。如果您在公司注销过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。