借条中约定违约金一天0.05%（即每日万分之五）是否合法，需结合具体情况判断，但通常该比例在法律允许范围内，不过仍需注意总计不得超过法定上限。以下从不同角度详细分析：

1. 法律对违约金的基本规定

根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。这体现了法律对当事人意思自治的尊重。然而，约定的违约金并非毫无限制，其核心原则是“合理性”，即违约金应与违约造成的损失相当，不能过分高于实际损失，否则人民法院或仲裁机构有权根据当事人的请求予以适当减少。

2. 民间借贷中违约金的特殊限制

在民间借贷领域，除违约金外，还可能涉及逾期利息、其他费用等。根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的的规定》，出借人与借款人既约定了逾期利率，又约定了违约金或者其他费用时，出借人可以选择主张其中一项或多项，但总计超过合同成立时一年期贷款市场报价利率（LPR）四倍的部分，人民法院不予支持。

• 举例说明：假设合同成立时一年期LPR为3.65%，则其四倍为14.6%（年利率）。若借条中约定每日违约金为0.05%（即年利率18.25%），则单独看违约金比例已超过LPR四倍。但若未约定逾期利息或其他费用，或约定后总计未超过LPR四倍，则该违约金比例仍可能被法院支持（需结合具体案情判断）。若同时约定了逾期利息且总计超过LPR四倍，则超出部分将不被支持。

3. 违约金比例的合理性判断

• 一般标准：在非民间借贷的合同纠纷中，司法实践中通常认为，如果违约金超过造成损失的30%，即可认定为“过分高于造成的损失”，此时违约方有权请求法院或仲裁机构适当调整。
• 民间借贷中的考量：在民间借贷中，由于LPR四倍的限制，即使违约金比例本身看似合理（如每日0.05%），也需与其他费用（如逾期利息）总计后判断是否超过法定上限。

4. 实际操作建议

• 合理约定：在签订借条时，借贷双方应充分协商，根据实际情况合理设定违约金的比例和计算方式。既要考虑对违约行为的惩罚性，也要避免过高导致法律不支持。
• 法律合规：确保约定的违约金与其他费用总计不超过合同成立时一年期LPR的四倍，以符合法律限制。
• 及时咨询：如在合同履行过程中发生争议，或对违约金比例是否合法存在疑问，可直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业法律意见。

总结：借条中约定违约金一天0.05%是否合法，需结合具体案情（如是否涉及其他费用、LPR数值等）判断。但无论如何，都应确保违约金约定合法、合理，并符合法律对民间借贷的特殊限制。如有任何疑问或需要进一步帮助，请随时向我提问。