公司法人私吞股东入资款属于严重的违法行为，股东可通过以下途径处理，核心结论如下：

1. 内部协商与沟通
   股东可首先尝试与法人直接沟通，要求其说明资金去向并立即返还。若法人承认私吞行为并承诺返还，建议签订书面还款协议，明确还款期限、方式及违约责任（如逾期利息）。此步骤成本较低，但需保留沟通记录（如微信、邮件、录音）作为证据。

2. 启动公司内部救济程序

   • 查阅公司章程与财务记录：股东有权查阅公司会计账簿、凭证及银行流水，确认资金是否被挪用至法人个人账户或其他非公司用途。若法人拒绝提供，可依据《公司法》第33条向法院提起“股东知情权之诉”。
     
   • 召开股东会决议：若法人同时担任董事或高管，股东可提议召开股东会，通过决议要求其返还资金、赔偿损失，甚至罢免其职务。需注意决议程序需符合公司章程及《公司法》规定（如提前通知、表决权比例等）。

3. 刑事报案
   若法人私吞金额较大（通常达6万元以上），可能涉嫌《刑法》第271条的“职务侵占罪”或第272条的“挪用资金罪”。股东可向公安机关经侦部门报案，提交入资凭证、银行流水、法人承认私吞的证据（如录音、书面承诺）等。刑事程序启动后，法人可能面临刑事处罚，同时股东可通过刑事附带民事诉讼追偿损失。

4. 民事诉讼

   • 直接起诉法人：以“侵权责任纠纷”或“不当得利纠纷”为案由，要求法人返还资金并赔偿利息损失。需提供入资证明（如转账记录、验资报告）、法人私吞的证据（如财务记录、证人证言）。
     
   • 起诉公司要求赔偿：若法人行为构成表见代理或公司管理存在过错（如未建立财务监管制度），股东可同时起诉公司，要求其承担连带赔偿责任。

5. 行政投诉
   向市场监管部门举报公司存在“抽逃出资”或“财务违规”行为，市场监管部门可能对公司进行行政处罚（如罚款、吊销营业执照），间接推动法人返还资金。但行政程序通常作为辅助手段，需与其他法律途径配合使用。

关键提醒：

• 证据收集是核心，务必保留入资凭证、财务记录、沟通记录等原始材料；
  
• 若法人已将资金转移或挥霍，需尽快申请财产保全，防止其进一步转移资产；
  
• 涉及刑事犯罪时，刑事追责与民事赔偿可并行，但刑事程序优先（因涉及人身自由）。
  

如有进一步细节（如入资方式、法人身份、资金去向等），可向我补充说明，我会结合具体情形提供更精准的建议。