起诉书落款一般不能写代理检察长。以下是对此问题的详细分析：

1. 起诉书的性质与落款要求：

   • 起诉书是检察机关依法向人民法院提起公诉时制作的法律文书，它代表了检察机关的正式立场和意见。
   • 起诉书的落款通常应当是检察机关的名称，并由检察长或者经检察长授权的检察人员签名或盖章，以体现其正式性和权威性。

2. 代理检察长的身份与权限：

   • 代理检察长是在检察长暂时无法履行职责时，由上级检察机关指定或者本级检察机关内部推选产生的临时负责人。
   • 代理检察长在代理期间虽然行使检察长的职权，但其身份仍然是临时的，且其权限可能受到一定限制，特别是在涉及重大法律文书签署等关键事项上。

3. 起诉书落款写代理检察长的法律后果：

   • 如果起诉书落款写代理检察长，可能引发关于文书正式性和权威性的质疑。因为代理检察长的身份和权限可能不足以完全代表检察机关的正式立场。
   • 在法律实践中，起诉书作为重要的法律文书，其落款必须严格符合法律规定和检察机关的内部规范，以确保其法律效力和执行力。

4. 实际操作中的建议：

   • 在制作起诉书时，应当严格按照检察机关的内部规范和法律规定来撰写和落款，避免使用代理检察长等可能引发质疑的表述。
   • 如果确实需要由代理检察长参与起诉书的制作或审核过程，可以在起诉书内部注明其代理身份和参与情况，但在落款处仍应使用检察机关的正式名称和检察长（或经授权的检察人员）的签名或盖章。

总结来说，起诉书落款一般不能写代理检察长，而应当使用检察机关的正式名称和检察长（或经授权的检察人员）的签名或盖章。这是为了确保起诉书的正式性、权威性和法律效力。如果您在起诉书制作或相关法律事务方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。