在重大责任事故罪中，民事赔偿的责任主体主要包括直接从事生产、作业的人员以及对生产、作业负有组织、指挥、管理职责的负责人、管理人员、实际控制人、投资人等。以下是对这一问题的详细分析：
直接从事生产、作业的人员：
- 这类人员是生产、作业活动的直接参与者，他们在一线进行具体操作。如果因他们的违规行为，如擅自更改操作流程、忽视安全防护措施等，导致重大伤亡事故或其他严重后果，他们不仅可能面临刑事责任的追究，同时还需要承担相应的民事赔偿责任。例如，在某矿山开采作业中，矿工因违规操作导致坍塌事故，造成人员伤亡和财产损失，该矿工就需要对受害者进行民事赔偿。
对生产、作业负有组织、指挥、管理职责的负责人、管理人员、实际控制人、投资人等：
- 这类人员虽然不直接参与具体的生产操作，但他们对生产、作业活动负有重要的组织、指挥、管理职责。如果因他们的管理失职或违规行为，如明知存在安全隐患却拒不整改、不履行或不正确履行自己的管理职责等，导致重大责任事故，他们同样需要承担民事赔偿责任。例如，某工厂负责人因管理失职导致火灾事故，造成人员伤亡和重大经济损失，该负责人就需要对受害者进行民事赔偿。
民事赔偿的范围和计算方式：
- 民事赔偿的范围通常包括因事故导致的直接经济损失，如医疗费、误工费、护理费、交通费、住宿费、住院伙食补助费、必要的营养费等，以及因事故导致的间接经济损失，如残疾赔偿金、死亡赔偿金、被扶养人生活费等。
- 具体的赔偿数额需要根据受害者的实际损失和相关的法律规定进行计算。例如，医疗费根据医疗机构出具的医药费、住院费等收款凭证，结合病历和诊断证明等相关证据确定；误工费根据受害者的误工时间和收入状况确定；残疾赔偿金根据受害者丧失劳动能力程度或者伤残等级，按照受诉法院所在地上一年度城镇居民人均可支配收入或者农村居民人均纯收入标准，自定残之日起按二十年计算等。
法律建议：
- 在发生重大责任事故后，责任主体应积极与受害者或其家属进行协商，就赔偿事宜达成一致意见，并签订书面赔偿协议。
- 如果协商不成，受害者或其家属可以向人民法院提起民事诉讼，要求责任主体承担民事赔偿责任。
- 在处理民事赔偿事宜时，建议责任主体咨询专业律师，以确保自己的合法权益得到保障，并避免因处理不当而引发不必要的法律纠纷。
综上所述，重大责任事故罪中的民事赔偿责任主体主要包括直接从事生产、作业的人员以及对生产、作业负有组织、指挥、管理职责的负责人等。在处理此类事故时，应明确责任主体，并根据受害者的实际损失和相关的法律规定进行民事赔偿。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。