针对您提出的大件运输车超过超限运输证核定吨位的处罚问题，以下是我为您提供的详细解答：

大件运输车若超过超限运输证所核定的吨位，将面临一系列严格的法律处罚。这些处罚不仅依据超载的具体比例，还可能涉及多个相关法律法规，包括但不限于《道路交通安全法》、《公路安全保护条例》以及《超限运输车辆行驶公路管理规定》等。

一、超载比例与处罚标准

1. 超载未达30%：

   • 罚款：通常处以200元以上500元以下的罚款。
   • 扣分：根据地区规定，可能扣1分或3分。
   • 其他措施：公安机关交通管理部门可能会扣留机动车，直至违法状态消除，并可能要求卸载超限货物。

2. 超载30%以上未达50%：

   • 罚款：罚款金额在500元以上2000元以下。
   • 扣分：一般扣6分。
   • 其他措施：同样可能面临车辆扣留，并被责令卸载超限货物。

3. 超载50%及以上：

   • 罚款：罚款金额通常较高，可能达到1000元以上，具体上限依地区规定，部分地区可能设定为5000元以下或更高。
   • 扣分：扣6分。
   • 其他措施：可能面临吊销机动车驾驶证、车辆被强制报废等更严厉的处罚，并需承担加重的民事赔偿责任及可能的刑事处罚。

二、涉及道路运输管理的额外处罚

若超载车辆属于从事经营性道路货物运输的车辆，还可能面临道路运输管理方面的额外处罚：

• 一般情节：责令改正，并处以1000元以上3000元以下的罚款。
• 情节严重：可能吊销《道路运输证》，影响企业的正常运营。

三、其他严重后果

除了上述罚款和扣分外，超载行为还可能引发一系列严重后果：

• 吊销营运证与停业整顿：一年内违法超限运输超过3次的货运车辆，将被吊销车辆营运证；驾驶人将被责令停止从事营业性运输；道路运输企业若违法超限运输的车辆超过本单位总数的10%，将面临停业整顿，情节严重者将被吊销道路运输经营许可证，并向社会公告。
• 损害基础设施与增加事故风险：超载行为不仅会对公路设施造成损害，还会增加交通事故的风险，对驾驶员和其他道路使用者的安全构成威胁。

四、建议与注意事项

• 严格遵守法律法规：驾驶员和运输企业应严格遵守交通法规，拒绝超载，以确保道路交通安全并避免不必要的法律责任。
• 了解地区差异：处罚标准可能因地区而异，具体执行时还需参考当地的相关规定。
• 重视法律后果：超载行为不仅可能面临罚款和扣分，还可能引发更严重的法律后果，包括吊销驾驶证、车辆报废等。

综上所述，大件运输车超过超限运输证核定吨位的处罚是严厉且多层次的。为了保障道路交通安全和自身权益，请务必遵守相关法律法规，避免超载行为的发生。