内部股东协议在符合相关法律法规、意思表示真实、内容合法且不损害他人权益的前提下，是合法的。以下是对此问题的详细分析：
一、合法性基础
主体适格：
- 参与签订内部股东协议的股东必须具备完全民事行为能力，即年满18周岁且精神智力状况正常的自然人，或依法设立的法人组织。这是协议合法性的基础，确保协议双方具备签订和履行协议的能力。
- 明确的主体信息，包括参与股东的姓名、身份和股权比例等应准确无误，以便在协议履行过程中明确各方的权利和义务。
意思表示真实：
- 股东签订内部协议的行为必须是出于自愿，不存在欺诈、胁迫、重大误解等违法情形。这是协议合法性的重要条件，确保协议是双方真实意愿的体现。
- 所有参与协议的股东必须真实、自愿地表达其放弃或转让股权、调整股权结构、约定分红方式等意愿，以确保协议的合法性和有效性。
内容合法：
- 协议内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，如不得违反公司法关于股权转让、公司治理、利润分配等方面的规定。
- 协议不得以逃避公司债务为目的而签订，否则该约定无效。例如，股东之间不得通过协议约定将公司资产转移至个人名下以逃避债务。
- 协议中应详细规定股权调整、分红方式、决策机制等具体条件、方式、时间以及相关的权利义务，条款应清晰明确，避免歧义。
程序合法：
- 如果公司章程对股东协议有特别规定，必须按照章程规定的程序进行。例如，某些公司章程可能规定股东协议需经全体股东一致同意或特定比例股东同意后方可生效。
- 若协议涉及公司注册资本的减少、股权转让给外部投资者等法定程序，需履行相应的法律手续，如通知债权人、进行公告等。
二、可能影响合法性的情况
违反法律强制性规定：
- 如协议内容违反公司法关于股权转让的限制性规定，如未经其他股东过半数同意向外部投资者转让股权，可能导致协议无效。
- 若协议涉及非法集资、洗钱等违法行为，同样会被认定为无效。
损害他人利益：
- 当公司存在大量债务时，股东为逃避债务而恶意签订内部协议，损害债权人利益的，债权人有权请求法院撤销该协议。
- 协议若损害公司其他股东的合法权益，如通过不公平的分红方式剥夺其他股东的分红权，也可能导致协议无效。
三、具体案例分析
- 案例一：有限责任公司的股东甲、乙、丙三人私下达成协议，约定调整各自的股权比例，并明确了新的分红方式。若该协议符合公司章程的规定，且没有损害公司及其他相关方利益，则此协议合法有效。
- 案例二：股东为了逃避公司债务，通过内部协议将公司的优质资产转移至个人名下。这种行为损害了公司利益和债权人利益，违反了公司法的相关规定，因此该协议无效。
- 案例三：公司章程规定股权转让需经全体股东一致同意，但股东之间私下签订了股权转让协议并完成了股权变更登记。这种行为违反了公司章程的规定，可能导致协议无效或引发纠纷。
四、法律建议
- 在签订内部股东协议前，建议股东们充分了解相关法律法规和公司章程的规定，确保协议内容的合法性和程序的合规性。
- 协议中的每一项条款都应仔细斟酌，确保其符合法律法规的要求，并能够有效保护自身权益。特别是涉及股权转让、分红方式等关键条款时，应更加谨慎。
- 在签订和履行过程中，若出现争议或纠纷，应及时寻求法律途径解决，以避免潜在的法律风险。作为专业律师，我可以为您提供全面的法律咨询和纠纷解决服务。
综上所述，内部股东协议在满足一定条件下是合法的，并具有法律效力。为确保协议的合法性和有效性，建议在签订前充分了解相关法律法规和公司章程的规定，并严格按照规定进行操作。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。