个体工商户经营非法营运的罚款标准需根据具体违法情形确定，通常包括没收违法所得、罚款，情节严重的可能吊销营业执照或追究刑事责任。以下是详细分析：

1. 非法营运的认定
   非法营运指未取得道路运输经营许可，擅自从事道路运输经营活动的行为（如无证载客、货运等）。个体工商户若未办理相关许可手续（如《道路运输经营许可证》），即构成非法营运。

2. 行政处罚依据及标准
   根据《中华人民共和国道路运输条例》第六十三条：

   • 基础处罚：由县级以上道路运输管理机构责令停止经营，没收违法所得，并处违法所得2倍以上10倍以下的罚款；
     
   • 无违法所得或违法所得不足2万元：处3万元以上10万元以下的罚款；
     
   • 情节严重：如多次违法、造成重大事故等，可吊销营业执照或责令关闭。
     示例：若个体工商户非法载客获利1万元，可能面临2万至10万元罚款；若无违法所得，则直接处3万至10万元罚款。

3. 其他可能处罚

   • 车辆扣押：执法部门可暂扣用于非法营运的车辆；
     
   • 信用惩戒：违法信息可能纳入信用记录，影响后续经营或个人征信；
     
   • 刑事责任：若非法营运导致重大事故（如致人重伤、死亡），可能构成《刑法》第一百三十三条规定的“交通肇事罪”或“危险驾驶罪”，需承担刑事责任。

4. 个体工商户的特殊性
   个体工商户以个人或家庭财产承担无限责任，罚款可能直接执行经营者个人财产。若营业执照被吊销，经营者5年内不得再次申请相关许可。

建议：若已涉及非法营运，应立即停止违法行为，主动配合调查并补办手续。如对处罚有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。如有具体案件细节，可直接向我咨询，我会结合证据材料进一步分析。