在破产程序中，起诉股东执行款项是否属于破产财产，需根据款项性质及取得时间综合判断，一般情况下属于破产财产，但存在例外情形。以下从不同角度进行分析：
一、款项属于破产财产的一般情形
根据《中华人民共和国企业破产法》第三十条：“破产申请受理时属于债务人的全部财产，以及破产申请受理后至破产程序终结前债务人取得的财产，为债务人财产。”以及《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国企业破产法〉若干问题的规定（二）》第一条：“除债务人所有的货币、实物外，债务人依法享有的可以用货币估价并可以依法转让的债权、股权、知识产权、用益物权等财产和财产权益，人民法院均应认定为债务人财产。”
款项性质为债务人财产：若起诉股东的款项，本质上是债务人（即破产企业）对股东享有的债权，如股东未履行出资义务、抽逃出资等情形下，债务人要求股东返还的款项，那么该款项在破产申请受理时或受理后至破产程序终结前取得，均应认定为债务人财产，即破产财产。
款项取得时间在破产程序内：即使款项在破产申请受理后才通过诉讼等方式确定并执行到位，但只要该款项是基于破产申请受理前债务人已享有的债权而取得的，同样应纳入破产财产范畴。
二、款项不属于破产财产的例外情形
虽然一般情况下起诉股东执行款项属于破产财产，但也存在例外情况，即该款项可能因特定原因被排除在破产财产之外。例如：
款项已设定担保：若债务人（破产企业）在起诉股东前，已将该债权设定了担保（如质押），且担保权人在破产程序中依法行使了优先受偿权，那么该款项在扣除担保权人优先受偿的部分后，剩余部分才可能作为破产财产进行分配。但若担保权人的优先受偿权已完全覆盖该款项，则该款项将全部不属于破产财产。
款项涉及特定财产权益：若起诉股东的款项涉及债务人（破产企业）的特定财产权益，如特定物上的权利、特定账户内的资金等，且这些财产权益在破产申请受理前已被特定债权人通过法律程序（如保全、查封等）予以锁定，那么该款项在破产程序中可能无法被纳入破产财产进行分配，而是直接用于满足特定债权人的债权。不过，这种情况较为特殊，且需满足严格的法律条件。
三、实务操作建议
在破产程序中处理起诉股东执行款项时，建议采取以下措施：
及时申报债权：管理人应尽快对债务人（破产企业）的债权进行梳理和确认，包括起诉股东的债权，并及时向法院申报债权，以确保该债权能够纳入破产财产进行分配。
关注款项性质及取得时间：管理人应密切关注起诉股东款项的性质及取得时间，以判断该款项是否属于破产财产。若存在疑问或争议，应及时咨询专业律师或法院意见。
妥善处理例外情形：若起诉股东款项存在设定担保或涉及特定财产权益等例外情形，管理人应依法妥善处理，确保破产程序的顺利进行和各方当事人的合法权益得到保障。
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