结论：第三人撤销房屋买卖合同后，要撤销不动产证，通常需通过法律程序确认合同无效或被撤销，并据此向不动产登记机构申请变更登记。以下从法律程序、申请变更登记流程及注意事项三个角度进行详细分析。
一、法律程序
确认合同无效或被撤销：
- 合同无效情形：根据《民法典》的相关规定，若房屋买卖合同存在违反法律、行政法规的强制性规定、违背公序良俗、行为人与相对人恶意串通损害他人合法权益等情形，则合同无效。第三人可依法向法院提起诉讼，请求确认合同无效。
- 合同被撤销情形：若房屋买卖合同存在重大误解、欺诈、胁迫或显失公平等情形，受损害方有权请求法院或仲裁机构撤销合同。第三人若认为自身权益因合同受到损害，可依法申请撤销合同。
法律文书生效：
- 法院或仲裁机构作出的确认合同无效或撤销合同的判决、裁决生效后，即具有法律效力，是后续申请变更不动产登记的重要依据。
二、申请变更登记流程
准备材料：
- 生效的法律文书（如判决书、裁决书）原件及复印件；
- 不动产权属证书（如房产证）原件；
- 申请人身份证明（如身份证、户口本等）原件及复印件；
- 其他可能需要的材料，如不动产登记申请表、委托书等。
提交申请：
- 申请人（通常为原不动产权利人或第三人，根据具体情况确定）携带上述材料，前往不动产登记机构（如不动产登记中心）提交变更登记申请。
审核与登记：
- 不动产登记机构对提交的材料进行审核，确认无误后，办理变更登记手续，将不动产证上的权利人信息、房屋状态等更新为与法律文书一致的内容。
三、注意事项
及时申请：
- 一旦法律文书生效，应尽快向不动产登记机构申请变更登记，以免因时间拖延导致不必要的麻烦或损失。
材料真实完整：
- 提交的材料必须真实、完整、有效，否则可能导致申请被驳回或登记错误。
关注登记进度：
- 申请人可关注不动产登记机构的登记进度，及时了解变更登记的办理情况。
法律后果：
- 若因合同无效或被撤销导致不动产证被撤销或变更，原不动产权利人可能面临返还财产、赔偿损失等法律责任。因此，在房屋买卖过程中，各方应谨慎行事，确保合同合法有效。
举例说明：假设甲与乙签订了一份房屋买卖合同，但该合同因存在欺诈情形被法院撤销。甲作为受损害方，在法院判决生效后，可携带判决书、房产证、身份证等材料，前往不动产登记机构申请变更登记，将房产证上的买受人信息从乙变更为甲（或根据实际情况进行其他变更）。
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