针对您提出的“违法占用土地的行政处罚程序规定”这一问题，以下是我为您提供的详细且深入的解答：
一、行政处罚的总体原则
违法占用土地将面临严格的行政处罚，这些处罚旨在恢复土地的合法状态，保护土地资源，并维护土地管理秩序。行政处罚的种类和程度将依据违法情节的轻重、土地类型及后果的严重程度来综合确定。
二、具体行政处罚措施
责令退还非法占用的土地
- 县级以上人民政府自然资源主管部门或土地行政主管部门将责令违法者将非法占用的土地退还给原土地所有者或使用者。若占用的是公共用地或尚未明确使用权的国有土地，则需恢复至占用前的状态。
限期拆除与没收建筑物和其他设施
- 对于在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，若违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，将责令违法者在规定期限内自行拆除，恢复土地原状。
- 若新建的建筑物和其他设施符合土地利用总体规划，但建设行为违法，则这些建筑物和设施将被没收，归国家所有，并依法进行后续处置。
罚款
- 罚款额将根据违法情节的轻重、土地类型及占地面积大小等因素综合确定。一般而言，非法占用土地每平方米罚款额为100元以上1000元以下。
- 对于特定类型的土地，如永久基本农田，每平米罚款可达1000元；占用其他土地者，每平米罚款可能在500至800元不等。
- 破坏耕地的行为还将面临耕地开垦费5倍以上10倍以下的罚款，破坏黑土地等优质耕地的将从重处罚。
行政处分
- 对非法占用土地的单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员，将依法给予行政处分。行政处分种类包括警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等，具体处分将根据违法情节、危害后果以及责任程度等因素来确定。
三、行政处罚的程序
立案调查
- 自然资源主管部门或土地行政主管部门在发现违法占用土地行为后，将进行立案调查，收集相关证据，查明违法事实。
告知与听证
- 在作出行政处罚决定前，主管部门将告知违法者拟作出的行政处罚内容及事实、理由、依据，并告知其依法享有的陈述、申辩、要求听证等权利。
- 若违法者要求听证，主管部门将组织听证会，听取违法者的陈述和申辩。
作出处罚决定
- 主管部门在充分考虑违法者的陈述、申辩意见后，将依法作出行政处罚决定，并书面送达违法者。
执行与监督
- 违法者应在规定的期限内履行行政处罚决定。若逾期不履行，主管部门将依法申请人民法院强制执行。
- 主管部门还将对行政处罚的执行情况进行监督，确保处罚决定得到有效执行。
四、刑事责任与其他措施
- 若违法占用土地的行为情节严重，可能触犯刑法，构成非法占用农用地罪或其他相关犯罪。此时，违法者将面临刑事责任的追究，包括有期徒刑、拘役、罚金等。
- 此外，对于违法占用耕地进行非农建设的，若所在省份实行非农建设占补挂钩政策，那么在整改到位之前，将先行冻结其相应的储备补充耕地指标。
- 主管部门还将与法院、检察院和公安机关紧密合作，充分利用行政执法与非诉执行监督、行政执法与公益诉讼、行刑衔接等协作配合机制，提升执法工作的质量和效率。
综上所述，违法占用土地将面临严厉的行政处罚、刑事责任追究以及其他多种处罚措施。因此，任何单位和个人在使用土地时都必须严格遵守土地管理法规，确保合法合规，以避免不必要的法律风险和经济损失。