企业使用合同专用章一般不需要进行专门的登记，但需符合印章管理相关规定并确保使用合法合规。以下从不同角度进行分析：

1. 印章管理法规层面：目前并没有明确的法律法规强制要求企业对合同专用章进行专门的登记。不过，根据《国务院关于国家行政机关和企业事业单位社会团体印章管理的规定》，企业印章的刻制需到公安机关指定的刻章单位刻制，且刻制完成后需在公安机关进行备案。这里的备案主要是针对印章的刻制合法性及印章的基本信息（如印章名称、规格、材质等），并非针对每一次使用行为的登记。
2. 企业内部管理层面：虽然法律没有强制要求使用登记，但企业为了规范内部管理、防范法律风险，往往会自行建立印章使用登记制度。通过登记，可以记录合同专用章的使用时间、使用人、使用合同名称及编号等关键信息，便于企业追踪和审查印章的使用情况，一旦出现问题能够及时追溯和查明责任。例如，某企业在内部印章管理制度中明确规定，每次使用合同专用章必须填写《印章使用审批单》，详细记录使用事项，并经相关部门负责人审批签字后方可使用，同时将审批单存档备查。
3. 法律风险防范层面：不进行使用登记可能会给企业带来一定的法律风险。如果合同专用章被不当使用，如被未经授权的人员私自使用签订虚假合同，或者在同一合同上重复使用印章导致合同条款解释争议等，企业可能难以证明自身无过错，从而承担不必要的法律责任。而完善的使用登记制度可以在一定程度上证明企业对印章使用进行了合理的管理和监督，有助于企业在法律纠纷中维护自身权益。