在刑事案件中，若被告人属于精神二级残疾，通常应当适用强制医疗程序或考虑其刑事责任能力进行普通刑事程序中的特殊处理。以下是对此问题的详细分析：
一、强制医疗程序的适用
法律依据：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第三百零二条：“实施暴力行为，危害公共安全或者严重危害公民人身安全，经法定程序鉴定依法不负刑事责任的精神病人，有继续危害社会可能的，可以予以强制医疗。”
适用条件：
- 被告人实施了暴力行为，且该行为危害了公共安全或严重危害了公民人身安全。
- 被告人经法定程序鉴定为依法不负刑事责任的精神病人。
- 被告人有继续危害社会的可能性。
程序流程：
- 公安机关发现精神病人符合强制医疗条件的，应当写出强制医疗意见书，移送人民检察院。
- 人民检察院对于公安机关移送的或者在审查起诉过程中发现的精神病人符合强制医疗条件的，应当向人民法院提出强制医疗的申请。
- 人民法院在审理案件过程中发现被告人符合强制医疗条件的，可以作出强制医疗的决定。
二、普通刑事程序中的特殊处理
刑事责任能力的鉴定：
- 若被告人虽为精神二级残疾，但并未完全丧失辨认或控制自己行为的能力，即具有部分刑事责任能力，那么其仍需承担相应的刑事责任，但可以从轻或减轻处罚。
- 此时，案件将按照普通刑事程序进行审理，但会考虑被告人的精神状况对其刑事责任能力的影响。
审理过程中的特殊考虑：
- 在审理过程中，法院会充分考虑被告人的精神状况，可能要求提供精神鉴定报告作为证据。
- 法院在量刑时，会综合考虑被告人的犯罪情节、精神状况、社会危害程度等因素，作出公正的判决。
三、实际操作中的建议
及时申请精神鉴定：
- 在案件初期，应尽快为被告人申请精神鉴定，以确定其刑事责任能力。
准备充分的证据：
- 收集并整理与被告人精神状况相关的证据，如医疗记录、诊断证明等，以便在审理过程中提供有力的支持。
寻求专业法律帮助：
- 由于涉及精神残疾的刑事案件较为复杂，建议寻求专业律师的帮助，以确保被告人的合法权益得到充分保障。
总结来说，若刑事案件中的被告人属于精神二级残疾，且符合强制医疗的条件，那么应当适用强制医疗程序；若被告人具有部分刑事责任能力，则案件将按照普通刑事程序进行审理，但会考虑其精神状况对刑事责任能力的影响。在处理此类案件时，建议及时申请精神鉴定、准备充分的证据，并寻求专业法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。