全民所有制公司并不直接适用《中华人民共和国公司法》，而是主要受《中华人民共和国全民所有制工业企业法》及相关法规的调整。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与差异
全民所有制企业的法律依据：
- 全民所有制企业的设立、运营、变更及终止等主要遵循《中华人民共和国全民所有制工业企业法》（该法同样适用于全民所有制交通运输、邮电、地质勘探等领域的企业）以及《全民所有制工业企业转换经营机制条例》等法律法规。这些法律针对全民所有制企业的特性，详细规定了企业的权利与义务、厂长（经理）负责制及职工代表大会制度等核心内容。
公司制企业的法律依据：
- 公司制企业，包括有限责任公司和股份有限公司，则依据《中华人民共和国公司法》设立。该法全面规范了公司制企业的设立流程、组织架构、股东权益与义务、公司治理机制、合并分立及解散清算等各个方面。
组织形式与产权结构差异：
- 全民所有制企业的财产属于全民所有，国家按照所有权与经营权分离的原则，授予企业进行经营管理。企业对这部分财产享有占有、使用和依法处分的权利。在组织结构上，实行厂长（经理）负责制，厂长（经理）作为企业的法定代表人，领导企业的决策与经营。
- 公司制企业的产权结构则基于股东的出资构建。股东以其出资额或所持股份为限对公司承担有限责任，而公司则以其全部财产对债务承担责任。公司内部设有股东会（股东大会）、董事会、监事会等完善的法人治理结构，各机构间相互制衡，确保公司治理的有效性。
二、国有企业改革与适用法律的变化
- 随着国有企业改革的深入，许多全民所有制企业通过改制转变为公司制企业。完成改制后，这些企业将遵循《公司法》的相关规定进行运营和管理，不再受《全民所有制工业企业法》的直接约束。这一变化体现了国有企业改革在产权结构、管理体制等方面的深化，也反映了法律对不同类型企业调整的灵活性和适应性。
三、实际应用指导
- 在处理涉及全民所有制企业的法律问题时，应首先参照《中华人民共和国全民所有制工业企业法》及相关法规的规定。这些法规针对全民所有制企业的特性，提供了具体的法律指导和规范。
- 对于已完成改制的全民所有制企业，则需依据《公司法》进行相应的法律分析和处理。这要求律师在处理相关案件时，要准确识别企业的法律性质，以便正确适用法律。
- 鉴于国有企业改革的持续性和复杂性，律师在实际操作中还需密切关注相关政策动态和法律法规的更新。这有助于确保为客户提供准确、有效的法律服务，避免因法律变化而导致的法律风险。
综上所述，全民所有制公司并不直接适用《公司法》，而是有其独特的法律调整体系。在处理相关法律问题时，应准确识别企业的法律性质，并依据相应的法律法规进行分析和处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。