针对您提出的“刑事案件取保侯审后认罪认罚后检查院不起诉会有案底吗”这一问题，我可以明确地告诉您：在刑事案件中，如果取保候审后认罪认罚，且检察院最终决定不起诉，那么通常情况下是不会留下案底记录的。

分析说明

1. 不起诉的法律意义：

   • 不起诉表示案件没有进入到法院的审判环节，也就意味着没有被判定有罪。在刑事诉讼中，未经法院定罪，就不会产生犯罪记录，即通常所说的“案底”。

2. 取保候审的性质：

   • 取保候审是刑事诉讼过程中的一种强制措施，它本身并不是刑罚制裁。其目的是为了确保犯罪嫌疑人能够随时到案接受调查，而不是对其罪行进行最终认定。

3. 认罪认罚的影响：

   • 认罪认罚是犯罪嫌疑人或被告人自愿、诚实地交代自己的罪行，并表示愿意接受法律的制裁。这一行为虽然表明了犯罪嫌疑人对罪行的认可，但并不意味着一定会被定罪。

4. 法律条款支持：

   • 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，对于情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；或者犯罪已过追诉时效期限的等情况，检察机关可以作出不起诉的决定。一旦不起诉决定生效，就意味着案件没有进入审判程序，因此不会留下案底。

特殊情况说明

虽然一般情况下不会留下案底，但也需要注意到一些特殊情况。例如，如果犯罪情节虽然轻微但具有一定的社会危害性，或者犯罪嫌疑人有多次违法记录等，这些因素可能会影响检察机关的决策，甚至可能在某些情况下导致酌定不起诉的决定对个体产生一定程度的不利影响。

结论总结

综上所述，刑事案件中取保候审后认罪认罚且检察院不起诉的情况下，通常是不会留下案底记录的。但也需要根据具体情况来分析，如果担心可能存在的特殊情况或不利影响，建议咨询专业律师进行进一步了解和评估。如果您有任何其他法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我提问。