刑事案件中，检察院不起诉是否会留下案底，主要取决于不起诉的具体类型及案情。以下是对此问题的详细分析：

一、法定不起诉（绝对不起诉）不会留下案底

• 情形：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条，法定不起诉的情形包括情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的；经特赦令免除刑罚的；依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；犯罪嫌疑人、被告人死亡的；以及其他法律规定免予追究刑事责任的。
• 法律后果：在这些情形下，由于犯罪嫌疑人根本不构成犯罪或者依法不应被追究刑事责任，因此不会留下案底。

二、酌定不起诉（相对不起诉）可能留下案底，但部分地区有特殊处理

• 情形：酌定不起诉是指犯罪嫌疑人的犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的。这是人民检察院对犯罪嫌疑人的一种从宽处理决定，但前提是犯罪嫌疑人的行为已经构成犯罪。
• 法律后果：
  • 一般情况：理论上，由于犯罪嫌疑人的行为已经构成犯罪，因此可能会留有案底。
  • 特殊情况：然而，目前部分地区对于符合特定条件的酌定不起诉案件，会探索进行案底封存等特殊处理方式，以减少对当事人的不利影响。这意味着，在某些情况下，即使犯罪嫌疑人的行为构成犯罪，也可能不会留下公开的案底记录。

三、证据不足不起诉不会直接留下案底

• 情形：证据不足不起诉是指对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的。
• 法律后果：这种情况下，并不等同于犯罪嫌疑人无罪，但也不意味着会直接留下案底。因为案底通常指的是因犯罪行为而被记录在案的情况，而证据不足不起诉只是表明当前证据不足以支持起诉，并未确认犯罪嫌疑人的犯罪行为。

四、建议与注意事项

• 了解不起诉类型：在面临检察院不起诉决定时，应首先了解不起诉的具体类型，以便判断是否会留下案底。
• 咨询专业律师：如果对检察院的不起诉决定有疑问或担忧，建议及时咨询专业律师，以便获得更详细的法律建议和指导。
• 关注后续影响：即使检察院决定不起诉，也应关注后续可能的影响，如是否会影响个人信用、就业等。在某些情况下，即使没有案底记录，也可能因其他因素而受到不利影响。

总结来说，刑事案件中检察院不起诉是否会留下案底，主要取决于不起诉的具体类型及案情。在面临此类情况时，建议及时咨询专业律师以获取更详细的法律建议和指导。如果有任何法律问题，都可以直接向我咨询。