未成年入监狱三年，是会有案底的。以下从多个角度为你详细分析：

案底的定义与性质

案底，通常指的是犯罪记录，即某人因犯罪行为被法院判决有罪后，所留下的相关记录。这些记录会被保存在公安机关、检察机关、法院等司法机关的档案中，作为个人犯罪历史的证明。对于未成年人而言，虽然他们在犯罪时可能因年龄原因而受到一定的法律保护，但一旦被法院判决有罪，同样会留下案底。

未成年人犯罪记录的特殊处理

1. 封存制度：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，犯罪的时候不满十八周岁，被判处五年有期徒刑以下刑罚的，应当对相关犯罪记录予以封存。这意味着，虽然未成年人有犯罪记录，但这些记录在一般情况下不会被公开查询，也不会对未成年人的未来生活产生过大的负面影响。然而，这并不意味着犯罪记录被完全消除，只是在特定条件下被封存起来。
2. 查询限制：犯罪记录被封存后，并非完全无法查询。在司法机关为办案需要或者有关单位根据国家规定进行查询时，仍然可以查询到这些记录。但查询的单位必须严格遵守保密义务，不得泄露未成年人的犯罪信息。

案底对未成年人的影响

1. 社会评价：尽管犯罪记录被封存，但在某些特定情况下，如求职、升学等，未成年人可能需要面对社会对其过去行为的评价。虽然法律禁止歧视有犯罪记录的未成年人，但在实际操作中，这种歧视可能仍然存在。
2. 再次犯罪的风险：有犯罪记录的未成年人，在再次犯罪时，可能会面临更严厉的刑罚。这是因为法院在判决时，会考虑被告人的前科情况，作为量刑的参考因素之一。

法律建议

1. 珍惜封存机会：对于有犯罪记录的未成年人而言，应当珍惜犯罪记录被封存的机会，努力改正错误，重新融入社会。通过积极的学习、工作和生活，展示自己的改变和进步，争取获得社会的认可和尊重。
2. 寻求法律帮助：如果未成年人在未来遇到与犯罪记录相关的问题或困扰，如求职受阻、升学受限等，可以寻求专业律师的帮助。律师可以根据具体情况，提供法律咨询和法律援助，帮助未成年人维护自己的合法权益。

总结来说，未成年入监狱三年是会有案底的，但这些记录在特定条件下会被封存起来。未成年人应当珍惜这个机会，努力改正错误，重新融入社会。如果遇到与犯罪记录相关的问题或困扰，可以随时向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。