关于学校孩子特定疾病协议书是否可以不签字的问题，这主要取决于协议书的性质、目的以及学校的相关规定，同时也要结合一般法律原则来进行分析。
首先，我们需要明确这份特定疾病协议书的具体内容和目的。通常，这类协议书可能是学校为了应对学生可能出现的特定疾病情况，而与学生家长或监护人签订的一种协议，旨在明确双方在处理学生疾病时的责任、义务和权利。这样的协议书往往涉及到学生的健康权益、学校的安全管理责任以及家长的监护责任等重要方面。
接下来，我们根据一般法律原则来分析：
自愿原则：在签订任何协议时，双方都应当是自愿的，没有强迫或欺诈的成分。如果家长或监护人认为协议书的内容不合理、不公平或侵犯了他们的合法权益，他们有权拒绝签字。
合法合规原则：协议书的内容必须符合国家法律法规的规定，不得违反公序良俗或损害社会公共利益。如果协议书的内容存在违法或违规之处，家长或监护人同样有权拒绝签字。
知情权原则：在签订协议书之前，家长或监护人应当充分了解协议书的内容、目的和可能产生的后果。如果学校未能提供充分的信息或解释，导致家长或监护人无法做出明智的决策，他们也有权拒绝签字。
然而，在实际操作中，我们还需要考虑以下几点：
学校的规定和要求：不同学校可能有不同的规定和要求，有些学校可能将签订特定疾病协议书作为入学或继续在校学习的必要条件。在这种情况下，家长或监护人需要权衡利弊，做出符合自己和孩子利益的决策。
孩子的健康和安全：如果孩子确实存在某种特定疾病，且该疾病可能对孩子的健康和安全构成威胁，那么签订协议书可能有助于学校更好地管理和照顾孩子，从而保障孩子的权益。在这种情况下，家长或监护人可能需要更加谨慎地考虑是否签字。
协商和沟通：如果家长或监护人对协议书的内容有疑问或担忧，他们可以与学校进行协商和沟通，寻求更加合理和公平的解决方案。通过协商和沟通，双方可能能够达成共识，从而签订一份更加符合双方利益的协议书。
综上所述，是否签字取决于家长或监护人对协议书内容、目的和可能产生的后果的充分了解，以及他们对自己和孩子利益的权衡。如果家长或监护人认为协议书合理、公平且符合法律法规的规定，同时也有利于保障孩子的健康和安全，那么他们可以选择签字；反之，如果他们认为协议书存在不合理、不公平或违法违规之处，或者签订协议书可能对孩子的权益造成损害，那么他们有权拒绝签字。在任何情况下，家长或监护人都应当保持理性、谨慎的态度，做出符合自己和孩子利益的决策。