关于光伏电站施工队打通房顶两个洞的赔偿问题，这并非一个简单的固定数额可以回答，而是需要综合考虑多个因素来确定赔偿金额。以下是我从不同角度为您详细分析的情况：
损害程度与修复费用：
- 首先，需要评估打通两个洞对房顶造成的具体损害程度。这包括但不限于房顶结构的稳定性、防水性能的破坏、保温层的损坏等。
- 接着，根据损害程度，计算修复这些损害所需的费用。这可能包括材料费、人工费、设计费（如果需要重新设计修复方案）等。修复费用是赔偿金额的重要组成部分。
房屋价值减损：
- 除了直接的修复费用，还需要考虑房顶被打通洞对房屋整体价值的影响。如果损害严重，可能导致房屋价值显著下降。
- 房屋价值的减损可以通过专业的房地产评估机构进行评估，以确定具体的减损金额。这部分金额也应纳入赔偿范围。
间接损失与额外费用：
- 如果房顶被打通洞导致您无法正常使用房屋，或者需要临时搬迁，那么因此产生的间接损失（如租房费用、生活不便带来的额外支出等）也应考虑在内。
- 此外，如果因施工队的过错导致您需要支付额外的法律费用（如律师费、诉讼费等），这些费用在合理范围内也应由施工队承担。
赔偿协商与法律途径：
- 在确定赔偿金额时，建议首先与施工队进行协商，尝试达成一个双方都能接受的赔偿协议。
- 如果协商无果，您可以考虑通过法律途径解决纠纷。在此过程中，您需要收集相关证据（如现场照片、视频、修复费用清单、房屋价值评估报告等），以支持您的赔偿请求。
- 法院或仲裁机构会根据实际情况，综合考虑上述因素，作出公正的裁决或调解。
具体赔偿金额的计算方式（假设仅考虑修复费用和房屋价值减损，且已通过评估确定具体数额）：
- 修复费用：假设为X元（根据实际修复所需材料、人工等费用确定）。
- 房屋价值减损：假设为Y元（根据房地产评估机构评估确定）。
- 间接损失与额外费用：假设为Z元（根据实际情况确定，如租房费用、法律费用等）。
则总赔偿金额 = X（修复费用） + Y（房屋价值减损） + Z（间接损失与额外费用）。
最后，我建议您：
- 尽快与施工队取得联系，说明情况并要求赔偿。
- 在协商过程中，保持冷静和理性，尽量通过友好方式解决问题。
- 如果协商无果，及时咨询专业律师（即我本人，李泳霄律师，专注于建设工程、经济纠纷、房产纠纷领域），了解您的法律权益和可能的赔偿途径。
希望以上分析能对您有所帮助。如果您有任何进一步的问题或需要更具体的法律建议，请随时向我咨询。