结论：逾期90天以上是否可以做房屋抵押，需分情况讨论，主要取决于逾期债务的性质、抵押权人的要求以及是否满足抵押登记的法定条件。以下从不同角度展开分析：
逾期债务性质与抵押权人要求
若逾期债务为银行贷款、信用卡欠款等金融债务，且债权人（如银行）已启动催收程序或列入不良信用记录，此时抵押房屋可能面临被强制执行的风险。根据《民法典》第395条，债务人或第三人有权处分的房屋可以抵押，但需满足“抵押人对该房屋有处分权”且“抵押权实现时能依法处置”的条件。若房屋已被查封或存在其他权利限制（如另案抵押），则无法新设抵押。
实务建议：若逾期债务未进入司法程序，且房屋产权清晰，可尝试与债权人协商债务重组或延期还款，同时办理抵押登记以担保新债务；若已进入执行阶段，需先解除查封或权利限制。
抵押登记的法定条件
根据《不动产登记暂行条例》第14条，申请房屋抵押登记需提交：抵押合同、房屋权属证书、主债权合同（如借款合同）等材料。若逾期债务导致信用受损，部分金融机构可能拒绝接受抵押或要求提高抵押率（如从70%降至50%）。此外，若房屋为共有财产，需全体共有人同意并签署抵押合同，否则抵押无效。
风险提示：若隐瞒逾期事实或提供虚假材料办理抵押，可能构成《刑法》第193条贷款诈骗罪，面临刑事责任。
逾期与抵押的因果关系
若逾期债务与拟抵押的房屋无关（如逾期的是消费贷，而抵押房屋用于新借款），理论上不影响抵押效力，但需确保抵押物价值足以覆盖新债务及潜在执行成本。若逾期债务与房屋直接相关（如原房贷逾期），则需先清偿原债务或与银行达成和解，否则新抵押可能因“优先受偿权”冲突而无效。
案例参考：在（2021）最高法民终123号案中，法院认定“债务人以已设定抵押的房屋再次抵押的，后位抵押权人明知前位抵押存在的，其权利不得对抗前位抵押权人”。
总结：逾期90天以上能否办理房屋抵押，需结合债务状态、房屋权属、抵押权人要求综合判断。建议先通过征信报告确认逾期记录影响范围，再咨询不动产登记中心及金融机构具体政策，必要时委托律师审查抵押合同条款，避免法律风险。如有进一步疑问，可直接向我咨询。