结论概述：员工是否有责任，需根据具体情况判断，包括员工是否知情、是否参与决策、是否尽到合理注意义务等。以下从不同角度详细分析。

一、员工是否知情并参与决策

1. 若员工不知情：

   • 如果员工完全不知情，只是按照公司的指示进行运输，且没有理由怀疑运输的物品存在违法或危险性，那么员工通常不承担责任。因为员工只是执行了公司的命令，且没有主观过错。

2. 若员工知情并参与决策：

   • 如果员工知道运输的物品是危险废物，并且参与了决策过程，如同意运输、协助安排运输等，那么员工可能需要承担一定的责任。因为员工在知情的情况下，仍然选择了参与违法行为，具有主观过错。

二、员工是否尽到合理注意义务

1. 尽到合理注意义务：

   • 如果员工在运输过程中，尽到了合理的注意义务，如检查运输物品、确认运输路线等，且没有发现任何异常或违法情况，那么员工可能不承担责任。因为员工已经采取了必要的措施来防止违法行为的发生。

2. 未尽到合理注意义务：

   • 如果员工在运输过程中，没有尽到合理的注意义务，如未检查运输物品、未确认运输路线等，导致危险废物被非法运输或处置，那么员工可能需要承担一定的责任。因为员工没有履行其应尽的职责，导致违法行为的发生。

三、公司责任与员工责任的关系

• 公司责任：危废公司作为法人，对危险废物的运输和处置负有主要责任。如果公司违法运输危险废物，公司及其直接负责的主管人员和其他直接责任人员可能面临行政处罚或刑事责任。
• 员工责任：员工是否承担责任，取决于其是否知情、是否参与决策以及是否尽到合理注意义务。如果员工存在过错，可能需要承担相应的法律责任，但通常这种责任会小于公司的责任。

四、法律建议

1. 对于员工：

   • 如果员工发现自己被要求运输危险废物，应立即向公司提出异议，并拒绝执行。
   • 如果员工已经参与了运输，且发现存在违法行为，应立即向相关部门报告，并配合调查。

2. 对于公司：

   • 公司应严格遵守相关法律法规，确保危险废物的合法运输和处置。
   • 公司应加强对员工的培训和教育，提高员工的法律意识和安全意识。

进一步思考：在实际操作中，员工和公司之间的责任划分可能更加复杂。如果员工对公司的违法行为存在疑虑或担忧，建议及时咨询专业律师，以了解自己的权利和义务，并采取必要的法律措施来保护自己。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供详细的解答。