要证明两个法人代表不同的公司实际上是同一家公司，不能直接通过法定代表人这一信息来证明，因为法定代表人不同本身就表明在法律形式上它们是两个独立的实体。不过，我们可以从其他多个角度来综合分析和证明两个公司之间的实质关联性：

1. 股权结构与控制关系：

   • 查阅公司章程和注册资料：通过国家企业信用信息公示系统或当地工商行政管理部门的官方网站，查询并获取两个公司的章程和注册资料，重点关注股东信息。如果两个公司的股东结构高度相似，特别是存在控股股东或实际控制人相同的情况，这可能是证明它们实质关联的重要线索。
   • 分析股权比例：进一步分析两个公司中主要股东的持股比例，如果存在一个或几个股东在两个公司中均持有较大比例的股份，甚至达到控股地位，这进一步增强了它们之间实质关联的可能性。

2. 经营管理与业务往来：

   • 考察经营场所与设施：实地走访两个公司的注册地址或实际经营场所，观察它们的办公环境、生产设施等是否相似或存在共用情况。
   • 分析业务往来：审查两个公司之间的业务合同、交易记录等，看是否存在频繁的关联交易或业务合作，这可能是它们实质关联的另一表现。

3. 人员配置与高管交叉任职：

   • 比对高管信息：除了法定代表人外，还可以比对两个公司的高管信息，如董事、监事、经理等。如果存在高管在两个公司中交叉任职的情况，这可能是证明它们实质关联的一个有力证据。
   • 了解员工情况：进一步了解两个公司的员工情况，看是否存在员工共享或频繁流动的情况，这也可能反映它们之间的实质关联。

4. 财务与税务情况：

   • 审查财务报表：获取两个公司的财务报表，分析它们的财务状况、资金流向等。如果存在资金频繁往来、财务数据高度相似等情况，这可能是证明它们实质关联的重要财务证据。
   • 核实税务信息：向税务机关申请核实两个公司的税务登记信息、纳税记录等，看是否存在税务方面的关联或异常情况。

5. 其他辅助证据：

   • 收集第三方证明：如可能的话，可以收集与两个公司有业务往来的合作伙伴、客户或供应商的证明，了解他们对两个公司关系的看法和了解情况。
   • 分析公司文化与品牌：观察两个公司的企业文化、品牌标识、宣传资料等是否相似或存在共用情况，这也可能是证明它们实质关联的一个辅助证据。

在收集和分析上述证据的过程中，需要注意以下几点：

• 确保证据的真实性和合法性：所有收集到的证据必须真实可靠，且来源合法，避免使用虚假或误导性的证据。
• 综合分析判断：不要仅凭单一证据就作出判断，而是要综合分析多个方面的证据，形成全面、客观的结论。
• 寻求专业帮助：如果遇到复杂情况或法律争议，建议直接向我咨询，我可以提供更具体的法律意见和指导。

最后需要强调的是，即使两个公司在实质上存在高度关联性，但在法律形式上它们仍然是两个独立的实体。因此，在处理涉及这两个公司的法律事务时，必须严格区分它们的法律地位和责任。