双方合同有涂改并各自盖了章子，这种情况是否有效，需分情况讨论：

1. 双方协商一致涂改并盖章：

   • 如果合同在履行过程中，双方经过协商一致，对合同的部分内容进行了涂改，并且各自在涂改处加盖了公章或合同专用章，那么这种涂改是有效的。因为双方已经就涂改内容达成了新的合意，涂改后的合同内容对双方均具有约束力。

2. 单方涂改并盖章，未经对方同意：

   • 如果是一方未经对方同意，擅自对合同进行涂改，并在涂改处加盖了自己的公章或合同专用章，那么这种涂改是无效的。因为单方涂改合同内容，违反了合同订立的自愿、公平、诚实信用原则，也损害了对方的合法权益。在这种情况下，被涂改方可以主张涂改部分无效，并要求按照原合同内容履行。

3. 涂改内容影响合同主要条款或目的：

   • 无论涂改是否经过双方协商一致，如果涂改的内容涉及到了合同的主要条款（如标的、数量、质量、价款或报酬、履行期限、地点和方式等）或者影响了合同的根本目的，那么都需要特别谨慎对待。在这种情况下，即使双方已经就涂改内容达成了合意，也可能因为涂改内容过于重大或影响合同平衡，而被认定为无效或需要重新协商。

法律建议：

• 在签订合同时，建议双方尽量明确合同条款，避免出现模糊或易产生歧义的内容。
• 如果需要对合同进行涂改，务必经过双方协商一致，并在涂改处加盖公章或合同专用章，以确保涂改的有效性。
• 如果发现对方擅自涂改合同内容，应及时与对方沟通协商，要求恢复原合同内容或就涂改部分达成新的合意。如果无法协商一致，可以考虑通过法律途径解决争议。

可能的法律后果：

• 如果涂改被认定为无效，那么双方应按照原合同内容履行义务。如果因涂改导致了一方损失，受损方有权要求涂改方承担赔偿责任。
• 如果涂改涉及到了合同诈骗等违法行为，涂改方还可能面临刑事责任的追究。

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