结论：关于法人机构合伙人设立合伙企业，合伙企业再设立有限责任公司，分红款是否可以穿透免税的问题，不能一概而论，需要分情况讨论。以下是对该问题的详细分析：
一、法人机构合伙人设立合伙企业的税务处理
法人机构作为合伙人的税务处理：
- 法人机构作为合伙企业的合伙人，其从合伙企业分得的收益，通常按照“先分后税”的原则处理。即合伙企业本身不缴纳企业所得税，而是由合伙人分别缴纳所得税。
- 对于法人机构合伙人，其从合伙企业分得的收益，应计入其应纳税所得额，并按照企业所得税法的规定缴纳企业所得税。
合伙企业设立有限责任公司的税务影响：
- 合伙企业设立有限责任公司，这一行为本身并不直接改变法人机构合伙人从合伙企业分得收益的税务处理方式。
- 有限责任公司作为独立的法人实体，其盈利需要缴纳企业所得税。但这一税务处理与法人机构合伙人从合伙企业分得收益的税务处理是分开的。
二、分红款穿透免税的可能性分析
一般情况下的税务处理：
- 在一般情况下，法人机构合伙人从合伙企业分得的收益，以及有限责任公司向其股东（可能是合伙企业或其他实体）分配的分红，都需要按照企业所得税法的规定缴纳企业所得税。
- 除非存在特定的税收优惠政策或免税规定，否则这些收益和分红通常不能免税。
特定情况下的免税可能性：
- 税收优惠政策：如果法人机构合伙人或有限责任公司符合某些税收优惠政策（如高新技术企业优惠、区域性税收优惠等），则可能享受免税或减税待遇。但这些优惠政策通常具有特定的适用条件和范围，需要具体分析。
- 穿透原则的应用：在某些特定情况下，如合伙企业投资于符合条件的创业投资企业，并享受创业投资企业的税收优惠政策时，可能存在分红款穿透免税的情况。但这种情况需要满足严格的条件，并且通常与创业投资企业的税收优惠政策相关联。
- 国际税收协定：如果涉及跨国投资或跨境分红，还可能需要考虑国际税收协定的规定。某些国际税收协定可能提供税收减免或抵免的条款，但同样需要满足特定的条件。
三、建议与风险提示
建议：
- 对于法人机构合伙人设立合伙企业，并进一步设立有限责任公司的情况，建议在进行税务筹划时充分考虑税务合规性和风险。
- 在享受任何税收优惠政策或免税待遇前，务必仔细研究相关法律法规和政策文件，确保符合适用条件。
- 如有需要，可以寻求专业税务顾问或律师的帮助，以确保税务筹划的合法性和有效性。
风险提示：
- 税务筹划必须遵守相关法律法规和政策规定，否则可能面临税务处罚和法律风险。
- 税收优惠政策通常具有时效性和条件性，需要密切关注政策变化并及时调整税务筹划策略。
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