在起诉有商号的个体工商户时，是否将经营者列为第二被告，需根据具体情况来分析，但通常建议将经营者列为共同被告。以下从不同角度进行详细分析：
一、法律主体与责任承担
个体工商户的法律地位：
- 个体工商户在法律上被视为自然人的一种特殊形态，其民事责任由经营者个人承担。然而，当个体工商户以商号名义进行经营活动时，商号作为经营者的标识，具有一定的法律意义。
经营者的责任：
- 经营者作为个体工商户的实际控制人，对个体工商户的债务和责任负有直接责任。在诉讼中，将经营者列为被告，有助于确保判决的顺利执行，因为经营者的个人财产可能用于清偿个体工商户的债务。
二、诉讼策略与实际操作
将经营者列为共同被告的益处：
- 确保执行：如前所述，将经营者列为共同被告可以增加判决执行的可能性，因为经营者的个人财产可以作为执行对象。
- 明确责任：在诉讼中，明确经营者的责任有助于法院更准确地判断案件事实，作出公正判决。
- 避免遗漏：如果仅起诉个体工商户而遗漏经营者，可能在执行阶段遇到困难，因为个体工商户的财产可能不足以清偿债务。
实际操作中的考虑：
- 证据收集：在起诉前，应收集足够的证据证明经营者的身份以及其与个体工商户的关系，如营业执照、税务登记证、经营者身份证明等。
- 诉讼文书准备：在起诉状中，应明确列出个体工商户的商号和经营者的姓名，并请求法院判决两者共同承担责任。
三、特殊情况下的处理
个体工商户已注销或吊销：
- 如果个体工商户已经注销或吊销，但经营者仍存在，且其财产与个体工商户的财产混同，那么将经营者列为被告是合理的，因为经营者可能需要承担个体工商户的剩余债务。
经营者变更：
- 如果个体工商户在经营过程中发生了经营者变更，且新经营者与旧经营者之间存在债务承接关系，那么在诉讼中可能需要将新旧经营者都列为被告，以明确各自的责任。
四、法律建议
- 在起诉有商号的个体工商户时，建议将经营者列为共同被告，以确保判决的顺利执行和责任的明确划分。
- 在准备诉讼材料时，应充分收集证据，证明经营者的身份以及其与个体工商户的关系，以便在诉讼中占据有利地位。
- 如果遇到特殊情况，如个体工商户已注销或吊销、经营者变更等，应及时咨询专业律师，以制定合适的诉讼策略。
综上所述，将经营者列为共同被告在起诉有商号的个体工商户时是一种较为稳妥的做法。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。