病假工资在支付时，确实会扣除社保个人缴纳部分，但这一扣除行为需遵循一定的法律规范和保障标准。以下是对这一问题的详细解答：

一、法律法规依据

1. 病假工资支付规定：

   • 根据《关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》第59条，职工在患病或非因工负伤治疗期间，企业应支付其病假工资或疾病救济费。这一工资可以低于当地最低工资标准，但不得低于最低工资标准的80%。

2. 社保缴纳规定：

   • 《中华人民共和国社会保险法》第六十条明确，用人单位应按时足额缴纳社会保险费，并代扣代缴职工应当缴纳的社会保险费。这意味着，从员工工资中扣除社保个人缴纳部分是用人单位的法定义务。

二、病假工资计算与社保扣除

1. 病假工资计算基础：

   • 病假工资的计算通常基于员工的标准工资或合同约定工资，并考虑连续工龄和病假时长。具体计算公式可能因地区和公司政策而异，但一般遵循（计算基数÷月计薪天数）×计算系数×病假天数的原则。

2. 社保扣除与病假工资关系：

   • 在计算病假工资时，首先按照规定的比例和标准计算出应发工资。然后，从应发工资中扣除社保个人缴纳部分及其他依法扣除的费用（如个人所得税）。这一扣除行为是用人单位代扣代缴的正常流程，并不影响病假工资的计算基数。

三、实际到手工资与最低保障

1. 实际到手工资计算：

   • 员工实际到手的病假工资是应发工资扣除社保个人缴纳部分及其他依法扣除的费用后的金额。这一金额可能因个人社保缴纳基数和病假工资标准的不同而有所差异。

2. 最低保障标准：

   • 用人单位在扣除社保后，支付给员工的实发工资需确保不低于当地最低工资标准的80%。同时，还需满足当地规定的基本生活费标准，以保障员工的基本生活需求。如果实际到手工资低于这一标准，用人单位可能面临法律风险。

四、具体示例

假设某地区月最低工资标准是2000元，某员工请病假，其病假工资按照最低工资标准的80%发放，即应发工资为2000×80%=1600元。若该员工社保个人缴纳部分每月是300元，那么实际到手的病假工资就是1600-300=1300元。这一金额需确保不低于当地规定的基本生活费标准。

综上所述，病假工资中扣除社保费用是符合法律法规的正常操作。但用人单位在支付病假工资时，应严格遵守相关法律法规，确保员工的合法权益得到保障。如果员工对病假工资或社保扣除有疑问，建议及时与用人单位沟通或咨询相关法律专业人士。