在配置医疗器械过程中，员工因失误被药监局查处，员工是否承担责任需根据具体情况分析，但通常员工可能面临行政责任，若情节严重还可能涉及刑事责任。以下从不同角度进行详细分析：
一、行政责任
依据相关法规：
- 根据《医疗器械监督管理条例》等相关法律法规，医疗器械的生产、经营、使用等环节都有严格的规定。员工在配置医疗器械过程中，若因失误违反了这些规定，如未按照规定的程序进行操作、未确保医疗器械的质量安全等，药监局有权对其进行查处。
可能的处罚：
- 药监局可能对员工进行警告、罚款等行政处罚。具体处罚措施会根据违规行为的性质、情节以及造成的后果等因素综合确定。例如，若员工的失误导致了医疗器械的质量问题，且该问题可能对患者造成危害，那么处罚可能会相对严厉。
二、刑事责任
情节严重的情况：
- 如果员工的失误行为情节严重，如导致了严重的医疗事故或患者伤亡，那么该员工可能构成犯罪，需要承担刑事责任。例如，若员工因疏忽大意未按照规定的程序进行医疗器械的消毒处理，导致患者感染严重疾病甚至死亡，那么该员工可能构成医疗事故罪或过失致人死亡罪等。
刑事责任的认定：
- 刑事责任的认定需要依据刑法的相关规定以及具体的案件事实。在判断员工是否构成犯罪时，会综合考虑其主观过错、行为性质、情节严重程度以及造成的后果等因素。
三、其他责任
民事责任：
- 若员工的失误行为导致了患者或医疗机构的损失，那么该员工还可能需要承担民事赔偿责任。例如，若员工因失误损坏了医疗器械，导致医疗机构无法正常使用该器械进行诊疗活动，那么该员工可能需要赔偿医疗机构因此遭受的损失。
内部责任：
- 除了法律责任外，员工还可能面临医疗机构内部的纪律处分或经济处罚。医疗机构通常会根据内部规章制度对违规员工进行相应的处理，以维护医疗秩序和保障患者安全。
建议与措施
加强培训与教育：
- 医疗机构应加强对员工的培训与教育，提高其对医疗器械配置、使用等环节的规范意识和操作技能，减少失误行为的发生。
完善内部管理制度：
- 医疗机构应完善内部管理制度，明确各岗位的职责和操作规范，确保员工在配置医疗器械过程中有章可循、有据可依。
及时应对与处理：
- 若员工因失误被药监局查处，医疗机构应积极配合调查处理工作，及时采取措施纠正违规行为、消除安全隐患，并依法承担相应的责任。
若您或您所在的医疗机构遇到此类问题，或有其他医疗医患（事故责任及赔偿）方面的疑问，可以直接向我咨询。我将结合您的具体情况，提供专业、全面的法律建议。