关于合同到期不续签的补偿金是否需要公司代缴税的问题，这主要取决于补偿金的数额与当地上年职工平均工资的比较。以下是对此问题的详细解答：

一、税务处理原则

1. 免征个人所得税的情况：

   • 根据相关规定，个人因与用人单位解除劳动关系（包括合同到期不续签）而取得的一次性补偿收入，如果其收入在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，是免征个人所得税的。这是对劳动者合理经济补偿的税收优惠政策。

2. 需要缴纳个人所得税的情况：

   • 当补偿金数额超过当地上年职工平均工资的3倍时，超出部分需要依法缴纳个人所得税。对于超出部分的税务处理，通常是将超出3倍数额部分的补偿金除以个人在本企业的工作年限数（超过12年的按12年计算），以其商数作为个人的月工资、薪金收入，然后依据综合所得税率表计算应缴纳的税额。

二、具体税务处理流程

1. 确定补偿金数额：

   • 首先，需要明确您获得的补偿金具体数额。这通常根据您在本单位工作的年限来计算，每满一年支付一个月工资的标准，六个月以上不满一年的按一年计算，不满六个月的支付半个月工资的经济补偿。

2. 比较当地上年职工平均工资：

   • 接着，需要了解当地上年职工的平均工资水平，并计算出其3倍的数额。这是判断补偿金是否需要扣税的关键标准。

3. 判断是否需要扣税：

   • 如果您的补偿金数额在当地上年职工平均工资3倍数额以内，则免征个人所得税；如果超过该标准，则超出部分需要按照上述方法计算并缴纳个人所得税。

4. 税务申报与缴纳：

   • 在收到补偿金后，如确定有应税部分，您应依法进行税务申报并及时缴纳相应的税款。这通常不是由公司直接代缴，而是需要您个人进行申报和缴纳，但公司可能会提供相关的税务指导或协助。

三、注意事项

• 由于各地区的职工平均工资水平存在差异，因此判断补偿金是否需要扣税以及具体的扣税标准时，必须结合当地的具体规定来执行。
• 如果您对税务处理有任何疑问或不确定之处，建议咨询专业的税务机构或律师以获取准确的税务指导。

综上所述，合同到期不续签的补偿金是否需要扣税，关键在于补偿金的数额与当地上年职工平均工资的比较。在实际操作中，您应根据自己的具体情况进行分析和处理，并确保税务处理的准确性和合法性。