校长因班主任没去值日而停课的行为，在大多数情况下是违法的。以下从不同角度为你详细分析：
法律角度
教育权保障：
- 根据《中华人民共和国教育法》的相关规定，学生享有接受教育的权利，任何组织或个人都不得非法剥夺学生的受教育权。校长因班主任未值日而停课，实际上是对学生受教育权的非法剥夺，因此这一行为在法律上是不被允许的。
学校管理权限：
- 学校虽然有一定的管理权限，但这种权限必须在法律规定的范围内行使。校长作为学校的管理者，其职责是维护学校的正常教学秩序，而不是通过停课等非法手段来惩罚教师或学生。班主任未值日，应属于教师工作纪律或职业道德范畴的问题，应通过内部管理机制来解决，而非直接停课。
实际操作与合理性角度
停课决定的合理性：
- 停课是一种较为严厉的处罚措施，通常应针对严重违反校规校纪或法律法规的行为。班主任未值日，虽然可能违反了学校的工作纪律，但这一行为并不构成严重违纪，因此停课决定在合理性上存在疑问。
内部管理机制：
- 学校应建立完善的内部管理机制，包括教师考核、奖惩制度等。对于班主任未值日等轻微违纪行为，应通过批评教育、扣发奖金等内部管理手段来处理，而不是直接采取停课等严厉措施。
可能的法律后果
学生权益受损：
- 如果校长因班主任未值日而停课，导致学生无法正常接受教育，学生或其家长有权向教育行政部门投诉或提起诉讼，要求学校恢复学生的受教育权，并可能要求学校承担相应的赔偿责任。
校长个人责任：
- 校长作为学校的管理者，如果因其非法行为导致学生权益受损，可能面临行政处分或法律责任。在严重情况下，甚至可能构成滥用职权罪等刑事犯罪。
建议：
- 如果你是学生或家长，遇到此类情况，可以首先与学校进行沟通协商，要求学校恢复学生的受教育权。
- 如果沟通无果，可以向当地教育行政部门投诉或提起诉讼，维护自己的合法权益。
- 如果你是教师或学校工作人员，对于校长的非法行为，也可以向相关部门进行举报或反映情况。
在处理此类问题时，务必保持冷静和理性，通过合法途径来维护自己的权益。如果你有任何进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。