结论：签合同两年后再按手印，合同的有效性并非单纯由按手印的时间点决定，而是取决于多个因素的综合考量。若合同本身合法合规，且按手印是当事人自愿、真实的行为，那么即使是在合同签订两年后按手印，合同依然可能有效。

详细分析：

1. 合同效力的基本原则：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同的效力主要取决于合同内容的合法性、当事人的民事行为能力、意思表示的真实性以及是否违背公序良俗等因素。
   • 按手印，作为一种身份确认方式，与签字、盖章在法律上具有同等的效力，都是当事人对合同内容表示确认并愿意受其法律约束的明确意思表示。

2. 按手印时间对合同效力的影响：

   • 合同的有效性并不直接受按手印时间的影响。关键在于按手印时，当事人是否自愿、真实地表示了对合同内容的认可和接受。
   • 如果合同在签订时已经具备所有生效要件（如合法合规的内容、当事人具备民事行为能力、意思表示真实等），那么即使是在两年后按手印，也不会影响合同的效力。
   • 然而，如果合同在签订时存在瑕疵（如内容违法、当事人不具备民事行为能力、意思表示不真实等），那么即使后来按了手印，合同也可能因存在根本性缺陷而无效。

3. 实际操作中的注意事项：

   • 在按手印前，应确保合同内容已经经过双方充分协商，且没有违反法律法规或违背公序良俗的条款。
   • 按手印时，应确保是当事人自愿、真实的行为，避免任何欺诈、胁迫等非法情形。
   • 如果可能的话，建议在按手印前对合同进行公证或见证，以增强合同的法律效力。

4. 特殊情况下的考虑：

   • 如果合同中明确规定了按手印的时间或条件，那么应严格按照合同约定执行。
   • 如果合同签订后发生了某些变化（如当事人身份变更、合同内容需要修改等），那么应在按手印前对这些变化进行充分协商并达成一致意见。

法律建议：

• 在签订合同时，应尽可能明确合同的所有条款和细节，包括按手印的时间、方式等，以避免后续产生纠纷。
• 如果对合同的效力或按手印的法律后果存在疑问，建议及时咨询专业律师（即向我咨询），以确保自己的合法权益得到保护。

可能法律后果：

• 如果合同合法有效且按手印是当事人自愿、真实的行为，那么合同将对双方产生法律约束力，任何一方违反合同约定都可能承担相应的法律责任。
• 如果合同存在瑕疵或按手印存在非法情形，那么合同可能无效或被撤销，双方可能因此免除相应的法律责任，但也可能因此遭受其他损失（如因合同无效而导致的交易成本增加等）。