分公司不能作为股东进行投资。以下从多个角度对此问题进行详细分析：

一、分公司的法律地位

分公司作为总公司的分支机构，并不具备独立的法人资格。根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，分公司是总公司的附属机构，其民事责任完全由总公司承担。这意味着分公司没有独立的财产体系，其所有资产均属于总公司财产的一部分。因此，从法律地位上看，分公司并不具备成为股东的资格。

二、入股的法律含义与限制

入股是指投资者通过购买公司股份成为公司股东，从而享有股东权利并承担股东义务。然而，由于分公司不具备法人资格，也没有自己的股份和股权结构，因此股东无法直接入股分公司。换句话说，分公司不是持有股权的适格主体，无法接受股东的直接投资。这一限制源于分公司没有独立的财产和法律责任能力，无法承担股东投资所带来的风险和责任。

三、股东的正确投资方式

虽然股东不能直接向分公司投资，但他们可以通过投资设立分公司的总公司来间接参与分公司的经营活动。具体做法是，股东可以增加对总公司的注册资本或购买总公司的股份，从而成为总公司的股东。这样，股东就能通过总公司基于自身经营安排将所获投资用于分公司的运营和发展，并享受总公司发展带来的收益。这种方式既符合法律法规的要求，又能实现股东的投资目的。

四、实际操作中的法律风险提示

1. 明确投资对象：股东在投资前应仔细核实投资对象的法律地位，确保是向具有法人资格的总公司进行投资，而不是向不具备法人资格的分公司投资。否则，投资协议可能因违反法律法规而无效。
2. 避免无效协议：如果股东错误地与分公司签订了投资入股协议书，这类协议在法律上通常是无效的。因为分公司没有权利接受他人的投资入股，所以此类协议无法产生法律效力。股东可能因此面临投资损失的风险。
3. 合规性审查：在进行投资时，股东应充分了解相关法律法规和公司章程，确保投资决策的合法性与合规性。必要时，可咨询专业律师进行法律风险评估和合规性审查，以降低投资风险。

总结与建议：

分公司不能作为股东进行投资，这是由其法律地位和入股的法律含义所决定的。股东应通过投资设立分公司的总公司来间接参与分公司的经营活动，并确保投资决策的合法性与合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。