结论：针对您网贷借了一万还掉五千，现在还不动且协商只还本金的情况，具体如何计算和处理，需根据您与网贷平台之间的协商结果以及相关法律法规来确定。以下是从不同角度为您进行的分析：
一、协商还款的合法性与效力
协商还款的合法性：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，借款合同是借款人向贷款人借款，到期返还借款并支付利息的合同。在借款合同履行过程中，双方可以协商变更合同内容，包括还款金额、还款期限等。
- 因此，您与网贷平台协商只还本金，不还剩余利息或部分利息，是合法的，但前提是双方能够达成一致意见。
协商还款的效力：
- 一旦双方达成协商还款的协议，该协议即具有法律效力，双方应按照协议内容履行各自义务。
- 如果您按照协商结果只还了本金，而网贷平台也接受了这一还款方式，那么双方之间的债权债务关系即按照协商结果进行了调整。
二、协商还款的计算方式
仅还本金的情况：
- 如果您与网贷平台协商成功，只还本金，那么您需要偿还的金额就是剩余未还的本金部分，即5000元（假设您已经还了5000元本金，剩余本金也为5000元，实际情况需根据借款合同和还款记录确定）。
- 在这种情况下，您不需要再支付剩余的利息或罚息等费用（除非协商中另有约定）。
部分减免利息的情况：
- 如果网贷平台同意减免部分利息，但并非全部免除，那么您需要偿还的金额将包括剩余本金和减免后的利息部分。
- 具体计算方式需根据协商结果和借款合同中的利息计算条款来确定。例如，如果协商减免了50%的利息，那么您需要支付的利息就是剩余本金乘以原利率再乘以50%。
三、协商还款的注意事项
书面协议：
- 为了确保协商还款的合法性和有效性，建议您与网贷平台签订书面协议，明确还款金额、还款期限等关键条款。
- 书面协议可以作为双方履行义务的依据，避免未来可能出现的纠纷。
保留证据：
- 在协商还款过程中，建议您保留好所有与网贷平台的沟通记录、协商记录以及还款凭证等证据。
- 这些证据可以在未来可能出现的纠纷中作为您履行义务或主张权利的依据。
法律风险：
- 如果协商还款未能达成一致意见，或者网贷平台在协商后反悔并要求您按照原合同履行还款义务，那么您可能面临法律风险。
- 在这种情况下，建议您及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并寻求合法的解决方案。
建议：针对您目前的情况，我建议您首先与网贷平台进行积极沟通，尝试达成协商还款的协议。如果协商成功，务必签订书面协议并保留好相关证据；如果协商不成或网贷平台反悔，您可以考虑通过法律途径来维护自己的合法权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。