农村自建房承包协议书在符合一定条件时确实具有法律效力。以下是对这一问题的详细解答：
一、农村自建房承包协议书的法律效力
有效条件：
- 双方自愿且意思真实：协议必须是双方当事人在平等、自愿的基础上，通过协商一致达成的，不存在欺诈、胁迫等情形。
- 内容合法：协议的内容不得违反国家法律法规的强制性规定，如不得违反土地用途管制、不得损害国家、集体或第三人的合法权益等。
- 形式合规：协议应当采用书面形式，并由双方当事人签字或盖章（或按手印等）确认，以表明双方对协议内容的认可。
法律效力：
- 满足上述条件的农村自建房承包协议书，一旦成立即具有法律效力，对双方当事人均具有法律约束力。
- 如果一方违反协议约定，另一方可以依据协议内容向法院提起诉讼，要求违约方承担相应的法律责任。
二、农村自建房承包协议书应明确的事项
为了确保协议的有效性和可执行性，农村自建房承包协议书应当明确以下事项：
- 建房具体事宜：包括建房的位置、面积、层数、结构等详细信息，最好有具体的坐标或四至范围。
- 双方权利义务：明确建房资金的分担方式、施工期限、质量标准、安全责任等双方的权利和义务。
- 违约责任：约定一方违约时应承担的责任和赔偿方式。
- 争议解决方式：约定在协议履行过程中发生争议时的解决方式，如协商、调解、仲裁或诉讼等。
三、注意事项
- 宅基地使用规定：农村宅基地使用有严格规定，如只能在本村集体内流转。协议内容不得违反此类规定，否则可能导致部分条款无效。
- 公证并非必要条件：虽然公证可以增强合同的证明力和公信力，但并非合同生效的必要条件。只要合同内容合法、双方意思表示真实且形式合规，即使未经过公证也具有法律效力。
- 保留证据：在协议履行过程中，双方应妥善保留相关证据，如合同文本、施工过程中的往来文件等，以利于在发生纠纷时维护自身合法权益。
综上所述，农村自建房承包协议书在符合一定条件时具有法律效力。为了确保协议的有效性和可执行性，双方当事人在签订协议时应明确建房具体事宜、双方权利义务等关键内容，并遵守相关法律法规和宅基地使用规定。