由主承销商券商支付中介机构费用，在符合一定条件和规定的情况下，是合规的。以下是对这一问题的详细分析：

1. 合规性前提：

   • 主承销商券商支付中介机构费用的行为，必须基于真实的业务需求和合理的费用标准。
   • 支付行为应遵守相关法律法规，如《证券法》、《公司法》以及相关的财务和会计规定。
   • 中介机构提供的服务应与其收费相匹配，且服务内容应合法合规。

2. 支付情形的合规性：

   • 在企业发行债券、股票等证券过程中，主承销商券商通常会聘请中介机构进行尽职调查、资产评估、法律咨询等工作。这些中介机构为发行过程提供了必要的专业支持，因此，主承销商券商支付其费用是合理的。
   • 支付费用时，应确保费用的金额、支付方式、支付时间等符合相关法律法规和监管要求，避免出现违规操作。

3. 风险与合规建议：

   • 主承销商券商在支付中介机构费用时，应建立完善的内部控制和风险管理机制，确保费用的合理性和合规性。
   • 建议主承销商券商在支付费用前，对中介机构的服务内容、收费标准等进行严格审查，并签订正式的服务合同，明确双方的权利和义务。
   • 如遇监管部门对支付中介机构费用的合规性提出质疑或调查，主承销商券商应积极配合，提供必要的资料和解释。

综上所述，由主承销商券商支付中介机构费用，在遵守相关法律法规和监管要求的前提下，是合规的。但为确保合规性，建议主承销商券商在支付费用时谨慎行事，建立完善的内部控制和风险管理机制。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。