针对您提出的“营运车丢失保险公司是否赔付营运损失”的问题，这主要取决于保险合同的约定、损失的性质以及相关法律法规的规定。以下是对此问题的详细解答：
一、保险合同约定与赔偿范围
交强险：
- 交强险主要针对交通事故中造成的第三方人身伤亡和直接财产损失进行赔偿。
- 一般情况下，交强险不赔偿营运车辆的营运损失，因为营运损失被视为间接损失，不在交强险的直接赔付范畴内。
商业三者险：
- 商业三者险是否赔偿营运损失，取决于保险合同的具体条款。
- 很多商业三者险条款会将间接损失（包括营运损失）列为免责范围。如果条款中明确排除了这类损失，并且保险公司已经尽到了明确说明和提示义务，那么保险公司将不承担赔偿责任。
- 但是，如果投保人与保险公司特别约定将营运损失纳入赔偿范围，并明确了赔偿条件和标准，那么在符合约定的情况下，保险公司应按约定进行赔偿。
车损险：
- 车损险主要赔偿被保险车辆自身因保险事故（如碰撞、自然灾害等）造成的损失。
- 它不涉及营运损失的赔偿，其保障重点在于车辆的修复费用。
二、损失的性质与证明材料
- 合理停运损失：依法从事货物运输、旅客运输等经营性活动的车辆，因道路交通事故造成无法从事相应经营活动所产生的合理停运损失，当事人有权请求侵权人赔偿。这里的“合理停运损失”指的是因事故导致的、必要的、且可预见的停运损失。
- 证明材料要求：为了成功申请营运损失的赔偿，您需要提供一系列证明材料，包括但不限于车辆登记人或营业执照复印件、车辆驾驶证和行驶证复印件、车辆维修及结算清单复印件等，以证明营运损失的实际存在和具体数额。
三、相关法律法规依据
- 《中华人民共和国保险法》：规定了保险人在收到赔偿请求后应及时核定并履行赔偿义务，同时强调了保险合同对赔偿责任的约定应得到尊重和执行。
- 《道路交通安全法》：规定了机动车发生交通事故造成人身伤亡、财产损失的，由保险公司在机动车第三者责任强制保险责任限额范围内予以赔偿，为营运损失的赔偿提供了法律基础（尽管交强险通常不直接赔付营运损失）。
- 《关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》：明确了依法从事经营性活动的车辆因道路交通事故造成无法从事相应经营活动所产生的合理停运损失，当事人有权请求侵权人赔偿。
结论
综上所述，营运车辆营运损失的赔偿问题涉及多个方面。在购买保险时，建议您仔细阅读合同条款，了解保险责任和赔偿范围。如果发生事故并导致营运损失，您应及时收集并保留相关证明材料，以便在需要时向保险公司申请赔偿。如果保险公司拒绝赔偿或双方无法协商一致，您可以考虑通过诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。