超市漏付款补损的计算方式需结合具体情形，一般以实际漏付金额为基础，结合超市规定、双方协商及法律规定综合确定。具体分析如下：

1. 以实际漏付金额为基准
   若消费者因疏忽（如未扫描商品、未结账等）导致漏付款，超市通常有权要求补缴漏付商品的实际价格。例如，漏付一件标价50元的商品，消费者需补缴50元。此情形下，补损金额直接以商品价格为准，无需额外支付其他费用。

2. 超市规定与协商结果的影响
   部分超市可能通过店内公告、会员协议等方式约定“漏付款需支付违约金”或“补缴金额上浮一定比例”。但此类规定需符合法律规定：

   • 若违约金或上浮比例明显高于实际损失（如漏付50元商品要求支付200元违约金），可能被认定为“显失公平”，消费者有权要求调整；
     
   • 若超市未提前告知此类规定，消费者可主张不知情，拒绝支付额外费用。
     因此，实际补损金额可能因双方协商或超市规定调整，但需以合法合理为前提。

3. 法律对补损金额的约束
   根据《民法典》第五百八十四条，违约方赔偿损失的金额应相当于因违约造成的损失，包括合同履行后可获利益，但不得超过违约一方订立合同时预见到或应当预见到的损失。
   在超市漏付款场景中，超市的实际损失通常为商品价格，因此补损金额一般不应超过商品价格本身。若超市主张其他费用（如人工核查成本、管理费等），需证明该费用与漏付款行为存在直接因果关系，且金额合理。

建议：

• 消费者发现漏付款后，应主动联系超市补缴商品价格，避免纠纷升级；
  
• 若超市要求支付额外费用，可要求其提供法律依据或协商解决；
  
• 双方无法达成一致时，可通过消费者协会调解或向法院起诉解决。
  

如有具体案例或金额争议，可直接向我咨询，我将结合细节进一步分析。