在承包国有土地时发现少量大树，核心前提是承包方需依法依规处理土地上的附着物，同时需兼顾生态保护与合同约定。以下是具体处理方向及建议：

1. 核查承包合同条款

• 优先审查合同：承包合同中可能明确约定土地现状（如是否包含树木）、承包方对附着物的处置权（如砍伐、移栽、保留）及责任划分。
• 若合同无约定：根据《民法典》合同编，双方可协商补充协议；若协商不成，需依据法律规定处理。

2. 区分树木权属与性质

• 权属判断：
  • 若树木为国有资产（如林业部门登记的公益林），承包方无权擅自处置，需报主管部门批准。
  • 若树木为原承包人或第三方所有，需通过合法程序（如购买、置换）取得权利。
• 保护级别：
  • 古树名木：受《森林法》《野生植物保护条例》严格保护，禁止砍伐、移植，需原地保护并报林业部门备案。
  • 普通树木：若非保护物种，可依法申请采伐许可后处理。

3. 依法申请采伐或移栽

• 采伐许可：
  • 需向县级林业主管部门提交申请，提供土地权属证明、树木权属证明、采伐设计文件等材料。
  • 采伐限额需符合年度计划，超限额采伐可能构成违法。
• 移栽替代：
  • 若树木具有生态或景观价值，可申请移栽至指定地点，需承担移栽费用及成活率责任。

4. 生态保护与补偿机制

• 生态补偿：
  • 若树木属于生态公益林，砍伐或移栽可能触发生态补偿义务，需按政府标准缴纳补偿费。
• 替代修复：
  • 部分地区要求“砍一补一”，即砍伐后需在指定区域补种同等数量树木。

5. 违规处理风险

• 行政处罚：
  • 未经许可砍伐树木，可能面临罚款（按树木价值倍数处罚）、没收违法所得、责令补种等。
• 刑事责任：
  • 砍伐国家级保护树种或大量树木，可能构成《刑法》中的“危害国家重点保护植物罪”或“滥伐林木罪”。

6. 协商与诉讼路径

• 与发包方协商：
  • 若树木影响承包用途（如农业种植），可要求发包方协助处理或调整承包范围。
• 行政复议/诉讼：
  • 若对林业部门行政许可或处罚不服，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。

建议行动步骤：

1. 立即停止对树木的任何处置行为，避免扩大法律风险；
   
2. 核查承包合同及树木权属证明；
   
3. 联系当地林业主管部门咨询具体流程；
   
4. 根据树木性质选择合法处置方式（保护、移栽、采伐）。
   

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。