在我国劳动法的框架下，公司并不具备直接对员工进行罚款的法律权力。罚款这一行为，本质上属于行政处罚的范畴，根据《中华人民共和国行政处罚法》的规定，只有具备行政处罚权的行政机关才能在法定职权范围内实施行政处罚。由于公司并非行政机关，因此它们没有法律上的罚款权力。

然而，在特定情况下，公司确实有权从员工工资中扣除部分款项，但这并非罚款，而是基于员工给公司造成经济损失的赔偿。具体来说，如果员工因个人原因给公司造成了经济损失，公司可以依据劳动合同的约定，要求员工进行赔偿。赔偿金额可以从员工的工资中扣除，但扣除的部分不得超过员工当月工资的20%。同时，如果扣除后的剩余工资低于当地的月最低工资标准，公司应按照最低工资标准支付员工工资。

此外，公司还可以通过制定合法有效的规章制度来设定经济惩戒措施，以维护正常的生产经营秩序和员工纪律。但这些措施必须满足以下条件：

1. 内容合法：规章制度的内容不得违反法律、法规的强制性规定，设定的经济惩戒措施应合理，不得出现明显不合理的情况。

2. 程序民主：公司在制定或修改涉及劳动者切身利益的规章制度时，应经过职工代表大会或全体职工的讨论，并与工会或职工代表进行平等协商确定。

3. 公示告知：公司应将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定进行公示，或通过员工手册发放、培训、公告栏张贴等方式让员工知晓。

另外，需要特别说明的是，《劳动合同法》规定了用人单位在特定情况下可向劳动者收取违约金的情形，但这并不等同于罚款。仅在用人单位为劳动者提供专项培训费用并进行专业技术培训，或用人单位与劳动者在劳动合同中约定保守商业秘密和与知识产权相关的保密事项时，用人单位才可与劳动者约定违约金。

综上所述，公司在管理过程中应严格遵守相关法律法规，确保对员工的任何经济处罚或惩戒措施都合法、合理，并充分保障员工的合法权益。如果员工认为公司的处理方式违反了相关规定，他们有权向劳动监察部门投诉举报，或通过劳动仲裁等法律途径来维护自己的合法权益。