针对无照经营超市，相关部门通常依据《无证无照经营查处办法》下达责令整改通知。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据

1. 《无证无照经营查处办法》：
   • 该办法明确规定了对于无照经营行为的查处措施。根据其中条款，经营者未依法取得许可从事经营活动的，由法律、法规、国务院决定规定的部门予以查处；法律、法规、国务院决定没有规定或者规定不明确的，由省、自治区、直辖市人民政府确定的部门予以查处。
   • 对于无照经营行为，相关部门有权责令停止违法行为，没收违法所得，并可以处以罚款。同时，对于情节严重的无照经营行为，相关部门还可以采取其他措施，如下达责令整改通知，要求经营者限期办理相关证照。

二、责令整改的具体应用

1. 责令整改的性质：

   • 责令整改是行政机关对违法行为人发出的一种行政命令，要求其在一定期限内改正违法行为。对于无照经营超市而言，责令整改通常意味着要求超市在规定期限内办理营业执照等相关证照，以合法经营。

2. 责令整改的流程：

   • 相关部门在发现无照经营超市后，会进行调查取证，确认违法事实。
   • 随后，相关部门会向超市发出责令整改通知，明确整改期限和要求。
   • 超市在收到责令整改通知后，应在规定期限内完成整改，并提交整改报告。
   • 相关部门会对超市的整改情况进行复查，确认其是否已合法经营。

三、法律后果与建议

1. 法律后果：

   • 如果超市未在规定期限内完成整改，相关部门可能会采取进一步的行政处罚措施，如罚款、查封、扣押等。
   • 长期无照经营还可能面临更严重的法律后果，如被吊销营业执照、承担刑事责任等。

2. 建议：

   • 对于无照经营超市而言，应尽快办理营业执照等相关证照，以合法经营。
   • 如果超市在办理证照过程中遇到困难或问题，可以寻求专业律师的帮助，以确保合法合规经营。

如有任何关于无照经营或相关法律问题的疑问，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，提供详细的法律建议和帮助。